Discussion :

[JonathanJohns]

Bonjour,

J'essaie de réaliser un graphique avec la fonction ggplot. Je souhaite mettre pour chaque jour la moyenne de ma variable avec l'écart-type en barre d'erreur.

Voici les graphiques que j'ai réalisé :



Et voici les codes correspondants :

Pour le graphique du haut :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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library(ggplot2)
E1=dataset[,1]
E2=dataset[,2]
E3=dataset[,3]
T1=colnames(dataset)[1]
T2=colnames(dataset)[2]
T3=colnames(dataset)[3]
 
# Données d'abscisses 
dates = as.POSIXct(dataset[,1])
dates = strptime(dates, "%Y-%m-%d") 
 
p<- ggplot(dataset, aes(x=dates, y=E2)) + 
  geom_line() +
 geom_point()+
  geom_errorbar(aes(ymin=E2-E3, ymax=E2+E3), width=.2,
                position=position_dodge(0.05))
p<- p+labs( x=T1, y = T2)
print(p)

Pour le graphique en bas :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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library(ggplot2)
E1=dataset[,1]
E2=dataset[,2]
E3=dataset[,3]
T1=colnames(dataset)[1]
T2=colnames(dataset)[2]
T3=colnames(dataset)[3]
 
p<- ggplot(dataset, aes(x=E1, y=E2)) + 
  geom_line() +
   geom_point()+
  geom_errorbar(aes(ymin=E2-E3, ymax=E2+E3), width=.2,
                position=position_dodge(0.05))
p<- p+labs( x=T1, y = T2)
print(p)

Je cherche à rajouter sur le graphique du bas la ligne continue comme sur celui du haut et le format date de l'abscisse identique à celui du haut mais je n'y arrive pas. Dès que je modifie mon axe X en format date, le graphique du bas se transforme comme celui du haut et je n'arrive plus à avoir les barres d'erreur comme elles sont actuellement dans le graphique du bas. Avez vous une proposition s'il vous plait ?

Bonne journée.

[tototode]

Bonjour,

pour que ce soit effectif il faut que les changements de variables se fassent dans le data.frame directement et pas en dehors ou alors dans ta fonction ggplot tu recrées un data.frame.
Par exemple avec un data.frame avec cette structure :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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str(dataset)
'data.frame':   59 obs. of  3 variables:
 $ E1: Date, format: "2018-01-01" "2018-01-02" "2018-01-03" "2018-01-04" ...
 $ E2: int  3 2 6 5 2 2 9 3 5 5 ...
 $ E3: num  0.948 0.641 0.895 0.88 0.761 ...
 
# le code suivant fonctionne parafaitement :
ggplot(dataset, aes(x = E1, y = E2)) + 
  geom_point() + geom_path() + 
  geom_errorbar(aes(ymin = E2-E3, ymax = E2 + E3))

Dans ton deuxième graph il ne me semble pas que tu es spécifié que E1 est au format date. Tu peux regarder du côté de as.Date aussi.

cdlt

[JonathanJohns]

Bonjour,

J'ai modifié dans le data frame le format date pour le mettre comme le votre mais le résultat est identique à précédemment. Pouvez vous me montrer le graphique que votre script vous renvoie s'il vous plait ?

[tototode]

le voici :

cdlt

[JonathanJohns]

Merci j'ai réussi à le mettre en place.

Si je souhaite modifier l'axe des abscisses pour avoir plus de détails au niveau des dates, comment faire s'il vous plait ? De même si je souhaite modifier les couleurs des barres d'erreurs ou de la courbe ou même le fond du graphique.

Merci pour votre réponse.

[tototode]

Bonjour,

pour ce qui est de l'axe des abcisses il te faut jouer avec la fonction scale_x_date et ces différents arguments. La librairie scales est aussi utile.

Code :

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tab <- data.frame(E1 = seq(as.Date("2018-01-01"), as.Date("2018-01-31"), by = "day"))
tab$E2 <- rpois(31, 4)
tab$E3 <- runif(31, 0.3, 0.6)
 
library(ggplot2)
library(scales)
 
g <- ggplot(tab, aes(E1, E2)) + geom_path() + geom_point()
g <- g + geom_errorbar(aes(ymin = E2-E3, ymax = E2+E3))
 
g + scale_x_date(labels = date_format("%d"), date_breaks = '1 week')
g + scale_x_date(labels = date_format("%d"), date_breaks = '1 month')
 g + scale_x_date(labels = date_format("%d"), date_breaks = 'day')

Pour ce qui est de la couleur tu peux rajouter color = ... dans les fonctions geom_path et geom_errorbar. Pour ce qui est de la couleur du fond il te faut jouer avec la fonction theme. Voir les nombreux tuto pour ggplot2 sur le net.

cdlt

[JonathanJohns]

Merci pour ces informations.