Discussion :

[aurora_sta]

Bonjour j'ai une matrice avec des données de comptage :

nom du gene	condition 1	condition 2	condition 2
gene1	5	10	15
gene2	10	15	20
gene3	0	0	0
gene4	100	200	150

les noms des gènes ne sont pas des rownames car certains sont identiques;
J'aimerais additionner les données de comptages qui correspondent à un nom de gène identique mais je ne sais pas comment m'y prendre.
J'ai identifier les lignes dupliquées (counts_array[duplicated(counts_array$GeneName)==T,])mais la je suis coincée.
Merci pour votre aide

[tototode]

Bonjour,

si ton objet est un data.frame :

Code :

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1
2
rowsum(counts_array[-1], counts_array$GeneName)
aggregate(. ~ GeneName, counts_array, sum)

cdlt