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R Discussion :

Echec de l'installation de RcmdrMisc pour l'installation de Rcmdr


Sujet :

R

  1. #1
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    Par défaut Echec de l'installation de RcmdrMisc pour l'installation de Rcmdr
    Bonjour à tous,

    Merci pour ce forum et bonne année !

    Je rencontre quelques difficultés avec mon nouveau PC MAC et le logiciel R.
    J'essaie de télécharger R commander mais je n'y parviens pas. Comme le PC est tout nouveau j'ai ré installer R, j'ai la version R.3.3.3 je pense.
    J'ai essayé de redémarrer l'ordi, d'installer les divers packages qu'il m'indiquait comme manquants, de désinstaller ré installer R, de passer par CRAN... mais je n'y arrive pas.
    Il semblerait qu'il manque RcmdrMisc mais celui-ci je n'arrive pas à l'installer, l'application R plante (il m'indique que R ne répond plus) dès que je lance l'installation et je suis obligée de forcer la fermeture de R pour débloquer la situation...
    Pour l'installer, je suis allée dans "packages et données", j'ai sélectionné l'installateur de packages, choisi le CRAN et installé avec les dépendances RcmdrMisc.
    Voilà les messages qui s'affiche (désolée je n'arrive pas à faire apparaitre les couleurs tout ca) lorsque j'essaie d'installer le package Rcmdr :

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    > install.packages("Rcmdr")
    Installation du package dans ‘/Users/cahuzacsalome/Library/R/3.3/library’
    (car ‘lib’ n'est pas spécifié)
    essai de l'URL 'https://cran.csiro.au/bin/macosx/mavericks/contrib/3.3/Rcmdr_2.4-1.tgz'
    Content type 'application/x-gzip' length 4814127 bytes (4.6 MB)
    ==================================================
    downloaded 4.6 MB
     
     
    Les packages binaires téléchargés sont dans
    	/var/folders/06/bzymskdd0px9cbhyvqqpn0_80000gn/T//RtmpM1uzga/downloaded_packages
    library("Rcmdr")
    > library("Rcmdr")
    Le chargement a nécessité le package : splines
    Le chargement a nécessité le package : RcmdrMisc
    Le chargement a nécessité le package : car
    Le chargement a nécessité le package : sandwich
    Error in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]) : 
      aucun package nommé ‘htmlTable’ n'est trouvé
    Erreur : le package ‘RcmdrMisc’ ne peut être chargé


    Je vous remercie pour votre aide précieuse.
    Cordialement
    Salomé

  2. #2
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    Bonjour,

    Un peu difficile de débugguer "à distance" les problèmes d'installations, mais avez-vous tenté la commande suivante ?

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    install.packages("Rcmdr", dependencies = TRUE)
    Elle permet d'installer le package "Rcmdr" ET les différents packages dont il dépend.

    HTH !


    Cordialement,


    A.D.

    Forum R
    Fournir le code utilisé (pensez aux balises code !), les packages nécessaires, ainsi qu'un court mais représentatif extrait du jeu de données et les éventuels messages d'erreur.
    Recherche d'informations concernant R : RSiteSearch / tutoriels : http://r.developpez.com/cours/ .

    Pensez également au bouton "Résolu" et à voter (en bas à droite des messages) lorsque vous avez obtenu une réponse satisfaisante.

  3. #3
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    Par défaut
    Bonjour,

    Merci pour votre aide.
    J'ai utilisé ce code déjà mais je re essaie de nouveau.

    > install.packages("Rcmdr", dependencies = TRUE)
    Installation du package dans ‘/Users/cahuzacsalome/Library/R/3.3/library’
    (car ‘lib’ n'est pas spécifié)
    installation des dépendances ‘coda’, ‘arm’, ‘mvtnorm’, ‘TH.data’, ‘matrixcalc’, ‘mi’, ‘aplpack’, ‘leaps’, ‘lmtest’, ‘multcomp’, ‘sem’


    Une version binaire est disponible mais la version du source est plus récente:
    binary source needs_compilation
    mvtnorm 1.0-6 1.0-7 TRUE

    Do you want to install from sources the package which needs compilation?
    y/n: y
    essai de l'URL 'https://cran.csiro.au/bin/macosx/mavericks/contrib/3.3/coda_0.19-1.tgz'
    Content type 'application/x-gzip' length 200219 bytes (195 KB)
    ==================================================
    downloaded 195 KB

    essai de l'URL 'https://cran.csiro.au/bin/macosx/mavericks/contrib/3.3/arm_1.9-3.tgz'
    Content type 'application/x-gzip' length 217880 bytes (212 KB)
    ==================================================
    downloaded 212 KB

    essai de l'URL 'https://cran.csiro.au/bin/macosx/mavericks/contrib/3.3/TH.data_1.0-8.tgz'
    Content type 'application/x-gzip' length 5200584 bytes (5.0 MB)
    ==================================================
    downloaded 5.0 MB

    essai de l'URL 'https://cran.csiro.au/bin/macosx/mavericks/contrib/3.3/matrixcalc_1.0-3.tgz'
    Content type 'application/x-gzip' length 165688 bytes (161 KB)
    ==================================================
    downloaded 161 KB

    essai de l'URL 'https://cran.csiro.au/bin/macosx/mavericks/contrib/3.3/mi_1.0.tgz'
    Content type 'application/x-gzip' length 1671910 bytes (1.6 MB)
    ==================================================
    downloaded 1.6 MB

    essai de l'URL 'https://cran.csiro.au/bin/macosx/mavericks/contrib/3.3/aplpack_1.3.0.tgz'
    Content type 'application/x-gzip' length 3159145 bytes (3.0 MB)
    ==================================================
    downloaded 3.0 MB

    essai de l'URL 'https://cran.csiro.au/bin/macosx/mavericks/contrib/3.3/leaps_3.0.tgz'
    Content type 'application/x-gzip' length 66541 bytes (64 KB)
    ==================================================
    downloaded 64 KB

    essai de l'URL 'https://cran.csiro.au/bin/macosx/mavericks/contrib/3.3/lmtest_0.9-35.tgz'
    Content type 'application/x-gzip' length 275365 bytes (268 KB)
    ==================================================
    downloaded 268 KB

    essai de l'URL 'https://cran.csiro.au/bin/macosx/mavericks/contrib/3.3/multcomp_1.4-8.tgz'
    Content type 'application/x-gzip' length 626582 bytes (611 KB)
    ==================================================
    downloaded 611 KB

    essai de l'URL 'https://cran.csiro.au/bin/macosx/mavericks/contrib/3.3/sem_3.1-9.tgz'
    Content type 'application/x-gzip' length 608687 bytes (594 KB)
    ==================================================
    downloaded 594 KB

    essai de l'URL 'https://cran.csiro.au/bin/macosx/mavericks/contrib/3.3/Rcmdr_2.4-1.tgz'
    Content type 'application/x-gzip' length 4814127 bytes (4.6 MB)
    ========
    downloaded 768 KB

    Error in download.file(url, destfile, method, mode = "wb", ...) :
    cannot download all files
    De plus : Warning messages:
    1: In download.file(url, destfile, method, mode = "wb", ...) :
    downloaded length 786432 != reported length 4814127
    2: In download.file(url, destfile, method, mode = "wb", ...) :
    URL 'https://cran.csiro.au/bin/macosx/mavericks/contrib/3.3/Rcmdr_2.4-1.tgz': status was 'Failure when receiving data from the peer'
    Warning in download.packages(pkgs, destdir = tmpd, available = available, :
    le téléchargement du package ‘Rcmdr’ a échoué

    Les packages binaires téléchargés sont dans
    /var/folders/06/bzymskdd0px9cbhyvqqpn0_80000gn/T//RtmpM1uzga/downloaded_packages
    installation du package source ‘mvtnorm’

    essai de l'URL 'https://cran.csiro.au/src/contrib/mvtnorm_1.0-7.tar.gz'
    Content type 'application/x-gzip' length 159381 bytes (155 KB)
    ==================================================
    downloaded 155 KB

    Warning in strptime(xx, f <- "%Y-%m-%d %H:%M:%OS", tz = tz) :
    unknown timezone 'default/Indian/Mahe'
    * installing *source* package ‘mvtnorm’ ...
    ** package ‘mvtnorm’ correctement décompressé et sommes MD5 vérifiées
    ** libs
    clang -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include -DNDEBUG -I/usr/local/include -I/usr/local/include/freetype2 -I/opt/X11/include -fPIC -Wall -mtune=core2 -g -O2 -c C_FORTRAN_interface.c -o C_FORTRAN_interface.o
    clang -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include -DNDEBUG -I/usr/local/include -I/usr/local/include/freetype2 -I/opt/X11/include -fPIC -Wall -mtune=core2 -g -O2 -c miwa.c -o miwa.o
    gfortran-4.8 -fPIC -g -O2 -c mvt.f -o mvt.o
    make: gfortran-4.8: No such file or directory
    make: *** [mvt.o] Error 1
    ERROR: compilation failed for package ‘mvtnorm’
    * removing ‘/Users/cahuzacsalome/Library/R/3.3/library/mvtnorm’

    Les packages source téléchargés sont dans
    ‘/private/var/folders/06/bzymskdd0px9cbhyvqqpn0_80000gn/T/RtmpM1uzga/downloaded_packages’
    Warning message:
    In install.packages("Rcmdr", dependencies = TRUE) :
    l'installation du package ‘mvtnorm’ a eu un statut de sortie non nul
    > library("Rcmdr")
    Le chargement a nécessité le package : RcmdrMisc
    Error in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]) :
    aucun package nommé ‘htmlTable’ n'est trouvé
    Erreur : le package ‘RcmdrMisc’ ne peut être chargé

    Je ne sais pas ce qui bloque...

  4. #4
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    Bonjour à tous,

    J'ai désinstalller et re installer R et RCMDR et maintenant le pb n'est plus RcmdrMisc mais Car....Je n'arrive pas à le télécharger non plus... Je suis désepérée

    > library("Rcmdr")
    Le chargement a nécessité le package : RcmdrMisc
    Le chargement a nécessité le package : car
    Error: package or namespace load failed for ‘car’ in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]):
    aucun package nommé ‘quantreg’ n'est trouvé
    Erreur : le package ‘car’ ne peut être chargé

    Merci par avance pour votre aide,
    Cordialement
    Salomé

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