Discussion :

[Muller Guy]

Bonsoir,
Après plusieurs heures de recherches j'ai enfin trouvé le fichier dans le sous-dossier !

Maintenant je veux lire ce fichier et le transférer danss une bas de données Sqlserver.

Première question : ce fichier est lisble en xml ?
Moi j'ai une réponse ... none

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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<?xml version="1.0" encoding ="UTF-8" standalone="no"?>
<db_achilles xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:noNamespaceSchemaLocation="Y:\DCIP\DataAchilles\Export\Tables\AchillesDBSchema.xsd" created="2017-12-22T10:34:24" dataherr="VD140">
<Patient records="54000">
<record>
<PatientNr>685362</PatientNr>
<Lastname>AAOUIDA</Lastname>
<Firstname>Samira</Firstname>
<AHVNr></AHVNr>
<Male>false</Male>
<DateOfBirth>1976-08-10</DateOfBirth>
<Profession></Profession>
<Field1>Maroc</Field1>
<Field2>AC</Field2>
<Field3>Aigle</Field3>
<Field4>Célibataire</Field4>
<Field5>Sans permis</Field5>
<Remark>Assurance: sans assurance£DateModif: 25.08.2017£DateCreation: 07.03.2008£</Remark>
<VeKaLastUpdate xsi:nil="true" />
<CustomerType></CustomerType>
<AddressNr>284</AddressNr>
<ImportantInfo></ImportantInfo>
<ImportantInfoOpen>false</ImportantInfoOpen>
<Barcode>ÌÊPÇdU^bÎ</Barcode>
<IncoiceCopy>false</IncoiceCopy>
<ZPModified>0</ZPModified>
<ZPDataOwner></ZPDataOwner>
<Passive>false</Passive>
<PassiveToken></PassiveToken>
<PassiveReasonOfDeath></PassiveReasonOfDeath>
<PassiveDate xsi:nil="true" />
<Death>false</Death>
<DeathToken></DeathToken>
<DateOfDeath xsi:nil="true" />
</record>

Voici mon code :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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import glob
import os.path
import xml.etree.cElementTree as ET
 
os.chdir('/Users/gmull/Documents/Python/Tables')
 
sPath = os.getcwd()
 
for filename in glob.iglob('/Users/gmull/Documents/Python/Tables/**/Patient*.xml', recursive=True):
                                    tree = ET.ElementTree(file=filename)
 
                                    root = tree.getroot()
 
                                    for child in root:
                                       print( child.get('PatientNr'))

Merci de bien vouloir m'aider sur ce sujet ...
Belle soirée

Muller Guy

[bm]

Le module glob qui permet de demander le listing du contenu d’un dossier en appliquant des filtres Unix.
Avec un fichier xml unique c'est pédaler dans le vide ..

[Muller Guy]

Bonjour à nouveau

Voici le fichier dans lequel je cherche le "PatientNr"

Je n'arrrive pas à afficher cette valeur, pouvez-vous m'aider, merci

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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<?xml version="1.0" encoding ="UTF-8" standalone="no"?>
<db_achilles xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:noNamespaceSchemaLocation="Y:\DCIP\DataAchilles\Export\Tables\AchillesDBSchema.xsd" created="2017-12-22T10:34:24" dataherr="VD140">
<Address records="54242">
<record>
<AddressNr>274</AddressNr>
<AddressType>1</AddressType>
<TitleFirm3></TitleFirm3>
<LastnameFirm1>xxxxx</LastnameFirm1>
<FirstnameFirm2>xxxxx</FirstnameFirm2>
<Remark></Remark>
<Street>Rue de Lausanne 21</Street>
<ZipCode>1020</ZipCode>
<City>Renens VD</City>
<Country>CH</Country>
<Tel1></Tel1>
<Tel2></Tel2>
<Fax1></Fax1>
<Fax2></Fax2>
<Mobile></Mobile>
<Email></Email>
<AddressToken>DESLARRenens</AddressToken>
<AddressGroup>Médecin</AddressGroup>
<SalutationLetter></SalutationLetter>
<EANNr>7601002117975</EANNr>
<SalutationAddress>Madame</SalutationAddress>
<Canton>VD</Canton>
<Field1></Field1>
<Field2></Field2>
<Field3></Field3>
<Field4></Field4>
<ZSRNr></ZSRNr>
<CompanyNr></CompanyNr>
<EANNr2></EANNr2>
<Modified xsi:nil="true" />
<AllowedTP>false</AllowedTP>
<Homepage></Homepage>
<DataownerZP></DataownerZP>
<TimestampZP>0</TimestampZP>
<URL></URL>
<Specialisation></Specialisation>
<ModifiedToken></ModifiedToken>
</record>

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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import glob
import os.path
from xml.etree import ElementTree
 
os.chdir('/Users/gmull/Documents/Python/Tables')
 
 
for filename in glob.iglob('/Users/gmull/Documents/Python/Tables/**/Patient*.xml', recursive=True):
        fName = os.path.abspath(os.path.join('data',filename))
        print (fName)
        XmlFile = ElementTree.parse(fName)
        Rec = XmlFile.findall('record/PatientNr')
 
        for lInfo in Rec:
            print(lInfo.text)

[wiztricks]

Voici le fichier dans lequel je cherche le "PatientNr"

Je n'arrrive pas à afficher cette valeur, pouvez-vous m'aider, merci

Voyez vous quelque chose qui ressemble à "PatientNr" dans le fichier que vous montrez?

- W

[bm]

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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file=open('data.xml','r')
 
for l in file:
    if 'AddressNr' in l :
        print 'ligne = ',l

ligne = <AddressNr>284</AddressNr>

C'est une ouverture de fichier avec test sur chaque ligne

[Muller Guy]

Bonjour,
je reprends mon exemple :

voici le début du fichier XML :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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<?xml version="1.0" encoding ="UTF-8" standalone="no"?>
<db_achilles xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:noNamespaceSchemaLocation="Y:\DCIP\DataAchilles\Export\Tables\AchillesDBSchema.xsd" created="2017-12-24T09:18:47" dataherr="VD140">
<Patient records="53992">
<record>
<PatientNr>685362</PatientNr>
<Lastname>xxx</Lastname>
<Firstname>aaa</Firstname>
<AHVNr></AHVNr>
<Male>false</Male>
<DateOfBirth>1976-08-10</DateOfBirth>
<Profession></Profession>
<Field1>Maroc</Field1>
<Field2>AC</Field2>
<Field3>Aigle</Field3>
<Field4>Célibataire</Field4>
<Field5>Sans permis</Field5>
<Remark>Assurance: sans assurance£DateModif: 25.08.2017£DateCreation: 07.03.2008£</Remark>
<VeKaLastUpdate xsi:nil="true" />
<CustomerType></CustomerType>
<AddressNr>284</AddressNr>
<ImportantInfo></ImportantInfo>
<ImportantInfoOpen>false</ImportantInfoOpen>
<Barcode>ÌÊPÇdU^bÎ</Barcode>
<IncoiceCopy>false</IncoiceCopy>
<ZPModified>0</ZPModified>
<ZPDataOwner></ZPDataOwner>
<Passive>false</Passive>
<PassiveToken></PassiveToken>
<PassiveReasonOfDeath></PassiveReasonOfDeath>
<PassiveDate xsi:nil="true" />
<Death>false</Death>
<DeathToken></DeathToken>
<DateOfDeath xsi:nil="true" />
</record>
<record>

et mon ccode pour la lecture de ce fichier :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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import glob
import os.path
from xml.etree import ElementTree
 
os.chdir('/Users/gmull/Documents/Python/Tables')
 
 
for filename in glob.iglob('/Users/gmull/Documents/Python/Tables/**/Patient*.xml', recursive=True):
        fName = os.path.abspath(os.path.join('data',filename))
 
        XmlFile = ElementTree.parse(fName)
 
        Rec = XmlFile.findall('record\PatientNr')
 
        for lInfo in Rec:
            print(lInfo.text)

Merci d'avance,

Muller Guy

[wiztricks]

Joyeux Noël!

ligne 14 vous avez écrit Rec = XmlFile.findall('record\PatientNr').
Est-ce que c'est une syntaxe XPATH valide et adaptée à vote contexte?

- W

[Muller Guy]

Bonsoir,
cela viens d'un tuto, en changenant le \ en / cela ne change rien !

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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import glob
import os.path
from xml.etree import ElementTree
 
os.chdir('/Users/gmull/Documents/Python/Tables')
 
 
for filename in glob.iglob('/Users/gmull/Documents/Python/Tables/**/Patient*.xml', recursive=True):
        fName = os.path.abspath(os.path.join('data',filename))
 
        XmlFile = ElementTree.parse(fName)
 
        Rec = XmlFile.findall('record/PatientNr')
 
        for lInfo in Rec:
            print(lInfo.text)

[fred1599]

Si le XML n'est pas complet, il n'y a pas d'intérêt à le présenter, car il ne sera pas forcément correctement et provoquera un message d'erreur au moment du parsing avec le module.

Maintenant pour ce genre de situation, si j'ai bien compris la demande (récupérer le chiffre 685362), on peut faire un test simple pour voir...

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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import xml.etree.ElementTree as ET
 
tree = ET.parse('monfichier.xml')
root = tree.getroot()
 
for child in root:
    if child.tag == 'PatientNr':
        print(child.text)

et voir ce que ça donne !

[wiztricks]

cela viens d'un tuto, en changenant le \ en / cela ne change rien !

Ben çà devrait fonctionner pour autant que l'extrait de XML que vous avez donné soit correct.
De toutes façons, quand vous avez un problème comme çà, vous pouvez résumer la structure de votre XML dans une chaîne de caractères. Par exemple:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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data = '''
       <Patient records="53992">
          <record>
             <PatientNr>685362</PatientNr>
             <Lastname>xxx</Lastname>
             <Firstname>aaa</Firstname>
          </record>
       </Patient>'''

Puis vous chargez ce XML avec un et.fromstring(data) puis vous essayez d'attraper les informations que vous voulez.
Cela permet de reproduire ce que vous faites (de vous éviter de poster des fichiers incomplets) et éventuellement de vous donner des pistes de solutions.
Chez moi et avec ce XML là, j'obtiens:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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>>> import xml.etree.ElementTree as et
>>> root = et.fromstring(data)
>>> for e in root.findall('record/PatientNr'):
...     print (e.text)
...
685362
>>>

- W

[bm]

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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<record>
      <PatientNr>685362</PatientNr>
      <Lastname>xxx</Lastname>
      <Firstname>aaa</Firstname>
</record>

Code :

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import lxml.etree as ET
tree = ET.parse('data1.xml')
print (tree)
root = tree.getroot()
 
 
for child in root:
    print (child.tag, child.text)
 
print('--------------------------')
 
for child in root:
    if child.tag == 'PatientNr':
        print (child.tag,':', child.text)

Tout dépend de la mise en forme du xml et de la distrib python ( conda )

<lxml.etree._ElementTree object at 0x7f904e5959c8>
PatientNr 685362
Lastname xxx
Firstname aaa
--------------------------
PatientNr : 685362

Plus court :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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from lxml import etree
tree = etree.parse("data.xml")
 
for record in tree.xpath("/data/record/PatientNr"):
    print (record.tag, record.text)
 
print ('-----------------------------------------')
 
for record in tree.xpath("/data/record/Field5"):
    print (record.tag, record.text)

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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<?xml version="1.0"?>
<data>
	<record>
		<PatientNr>685362</PatientNr>
		<Lastname>xxx</Lastname>
		<Firstname>aaa</Firstname>
		<AHVNr></AHVNr>
		<Male>false</Male>
		<DateOfBirth>1976-08-10</DateOfBirth>
		<Profession></Profession>
		<Field1>Maroc</Field1>
		<Field2>AC</Field2>
		<Field3>Aigle</Field3>
		<Field4>Célibataire</Field4>
		<Field5>Sans permis</Field5>
		<Remark>Assurance: sans assurance£DateModif: 25.08.2017£DateCreation: 07.03.2008£</Remark>
		<CustomerType></CustomerType>
		<AddressNr>284</AddressNr>
		<ImportantInfo></ImportantInfo>
		<ImportantInfoOpen>false</ImportantInfoOpen>
		<Barcode>ÌÊPÇdU^bÎ</Barcode>
		<IncoiceCopy>false</IncoiceCopy>
		<ZPModified>0</ZPModified>
		<ZPDataOwner></ZPDataOwner>
		<Passive>false</Passive>
		<PassiveToken></PassiveToken>
		<PassiveReasonOfDeath></PassiveReasonOfDeath>
		<Death>false</Death>
		<DeathToken></DeathToken>
	</record>
</data>

[Muller Guy]

Bonsoir à tous,
Grand merci pour vos messages.

Je ne sais pas pour quelle(s) raison(s) le code que vous me proposez ne fonctionne pas !

Finalement je suis revenu à une lecture simpifiée du fichier et c'est presque OK.

Si je tape print ,l j'ai le n° du patient
Je voudais placer cette valeur dans Patient = ,l mais cela ne fonctionne pas.

merci d'avance,
C'est certainement tout simple !!!

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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    file = open(fName, 'r', encoding ='UTF-8')
 
    for l in file:
        if 'PatientNr' in l:
            Patient =l
        if 'Lastname' in l:
            Lastname =l
            print(Patient + Lastname)

[wiztricks]

Je voudais placer cette valeur dans Patient = ,l mais cela ne fonctionne pas.

çà ne fonctionne pas? voilà qui est très vague.
Ca fait des choses mais peut être pas celles que vous attendez ou bien çà plante avec un message d'erreur.

Enfin si vous postez du code comme:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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    file = open(fName, 'r', encoding ='UTF-8')
 
    for l in file:
        if 'PatientNr' in l:
            Patient =l
        if 'Lastname' in l:
            Lastname =l
            print(Patient + Lastname)

outre qu'il soit impossible de reproduire quoi que ce soit sans le fichier d'entrée (et donc comprendre un peu mieux votre problème), la dernière instruction (le print) n'est pas dans le bloc où elle devrait être.

- W