Discussion :

[j_pns]

Bonjour à tous !

Je voudrais savoir s'il était possible d'importer des fichiers (peu importe le format) sur R avec comme nom du fichier le nom d'une variable.
En effet, j'aimerais que mon programme R fonctionne pour plusieurs fichiers.

Exemple :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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#import d'un dataframe nommé.
df <- read.csv("/Users/moi/Documents/mondataframe.csv",header=TRUE, sep=",")
 
#création de ma variable
ma_variable <- unique(df$colonne2)
 
#import de mon fichier avec nom variable
fichier <- read.csv("/Users/moi/Documents/ma_variable.csv",header=TRUE, sep=",")

Ma question est donc : est-il possible d'importer un fichier avec, comme nom du fichier, le texte stocké dans une variable ? Si oui, quelle est la syntaxe à utiliser ? (à la place de ma_variable dans le chemin d'import)

Je vous remercie !
Bonne journée

[olivier.decourt]

Bonjour.
Bien sûr, c'est possible. Ce que ton code n'indique pas, c'est si ton unique renvoie une ou plusieurs valeurs. S'il y a une seule valeur, c'est tout simple, il suffit de concaténer son contenu avec le reste du chemin (répertoire, extension). L'objet texte ainsi créé sert de premier argument à la fonction read.csv.
S'il y a plusieurs valeurs dans le vecteur créé par unique, la recette reste la même, concaténer les éléments "fixes" (répertoire, extension) avec paste et on obtient encore un vecteur. Il faut itérer sur chacun de ses éléments, ce qui n'est pas compliqué en soi mais pour récupérer l'import dans des objets de noms différents, le code sera peut-être plus intuitif avec une boucle.

[j_pns]

Merci beaucoup pour ta réponse !

En effet j'ai oublié de préciser que mon unique renvoie plusieurs valeurs.
J'aimerai ne pas avoir a écrire ce qui ressort de ma variable "unique". J'aimerai qu'en écrivant le nom de la variable le programme le fasse automatiquement.
Syntaxiquement parlant je n'ai pas compris comment je peux concatener ma variable dans mon chemin ...

Serait-il possible, sans vouloir que tu me mâches le travail, de reprendre mon exemple pour que je comprenne mieux ?
sans itération ou boucle. En faisant comme si mon unique ressortait une seule valeur. Car je n'ai pas compris le principe de "concatener les éléments fixes avec paste" ...

Je te remercie.

[olivier.decourt]

Bonjour.
Ce que je voulais dire, c'est que si ton unique renvoie une seule valeur, mettons "mondataframe", tu ajoutes les éléments fixes avec

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

paste0("/Users/moi/Documents/", ma_variable, ".csv")

Si tu as un vecteur avec plusieurs valeurs, paste0 va concaténer sur chaque élément du vecteur, donc même logique. Restera à ajouter la boucle.

[j_pns]

Faire cette boucle n'est pas suffisant pour récupérer les différentes valeurs de ma variable "unique" ?

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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#ma_variable
ma_variable=unique(df$colonne2) #cela me retourne 3 valeurs. #Ces 3 valeurs sont les noms de 3 fichiers que j'ai dans mes Documents, et que j'aimerai ouvrir, soit dans le même df soit dans 3 df différents. (ici j'ai essayé dans le même df (mon_df))
 
#ma boucle 
for (i in 1:length(ma_variable)){
  mon_df <- read.csv(paste0("/Users/Documents/",ma_variable[i],".csv"),header=TRUE, sep=",",na.strings = "NA")
}
 
#length(ma_variable)=3

Cette boucle stocke uniquement la dernière valeur de ma_variable (#ma_variable[3])

[olivier.decourt]

C'est logique puisqu'à chaque itération de la boucle tu écris dans le même objet, il est remplacé à chaque itération.
Par contre, si dans la boucle, tu fais un rbind de ton data.frame et du résultat de l'import, ça va bien tout accumuler.
Cela dit, il y a un moyen beaucoup plus simple de faire ça : read.csv accepte les noms incomplets read.csv("/Users/Documents/*.csv", header=TRUE, sep=",",na.strings = "NA") devrait lire tous les fichiers d'extension CSV de ton répertoire à la suite, et empiler automatiquement le tout dans ton data.frame.

[j_pns]

Exact ! je vous remercie ... j'ai pas été très futfut pour le coup.

Malheureusement je ne peux pas faire de rbind car mes fichiers n'ont parfois pas le même nombre de colonne...
Il me faudrait donc pouvoir les ouvrir tous séparément dans des data.frame différents. Cependant la technique du "*.csv" ne marche pas...

[mgdondon]

Bonjour,

Vous pouvez utiliser la fonction bind_rows() du package dplyr si vos fichiers n'ont pas toutes les colonnes en commun et que vous souhaitez les importer dans le même dataframe.

Cordialement,

[j_pns]

Etant donné que les colonnes ne sont pas les mêmes je ne souhaite pas importer dans le même data.frame non...
J'aimerai importer un fichier par data.frame

Je vous remercie tout de même pour votre réponse. Elle me sera peut être utile un jour !

Justine

[mgdondon]

Il me faudrait donc pouvoir les ouvrir tous séparément dans des data.frame différents.

Vous pouvez générer un nom de dataframe dans votre boucle:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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for (i in 1:length(ma_variable)){
  assign(paste0("df_",ma_variable[i]), read.csv(paste0("/Users/Documents/",ma_variable[i],".csv")))
}

Cordialement,

[j_pns]

WOW

Merci beaucoup !! c'est parfait