Bonjour à tous
Je souhaiterais selectionner une région spécifique à partir d'un fichier fastq. L'idée est d'aligner mon fichier contre une référence et de sélectionner tout les reads matchant cette région mais rogner les extrémités ne matchant pas. C'est ce dernier point qui me pose problème ; comment enlever les régions ne matchant sans retirer la partie du read qui s'aligne??
Merci beaucoup pour votre aide!
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