Discussion :

[Marims]

Bonjour,

Je souhaite installer le module commander de R par le package Rcmdr, mais je n'y arrive pas.
Voici ce qui s'affiche lorsque j'essaie de lancer l'installation :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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installation des dépendances ‘minqa’, ‘nloptr’, ‘RcppEigen’, ‘zoo’, ‘lme4’, ‘SparseM’, ‘sandwich’, ‘colorspace’, ‘e1071’, ‘readxl’, ‘pbkrtest’, ‘quantreg’, ‘RcmdrMisc’, ‘car’
 
Packages which are only available in source form, and may need compilation of C/C++/Fortran: ‘minqa’ ‘nloptr’ ‘RcppEigen’ ‘zoo’ ‘lme4’ ‘SparseM’ ‘colorspace’ ‘e1071’ ‘readxl’ ‘quantreg’
  These will not be installed
installation des packages sources ‘sandwich’, ‘pbkrtest’, ‘RcmdrMisc’, ‘car’, ‘Rcmdr’
 
essai de l'URL 'https://pbil.univ-lyon1.fr/CRAN/src/contrib/sandwich_2.3-4.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 466729 bytes (455 KB)
downloaded 455 KB
 
essai de l'URL 'https://pbil.univ-lyon1.fr/CRAN/src/contrib/pbkrtest_0.4-6.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 165269 bytes (161 KB)
downloaded 161 KB
 
essai de l'URL 'https://pbil.univ-lyon1.fr/CRAN/src/contrib/RcmdrMisc_1.0-5.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 22786 bytes (22 KB)
downloaded 22 KB
 
essai de l'URL 'https://pbil.univ-lyon1.fr/CRAN/src/contrib/car_2.1-3.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 622922 bytes (608 KB)
downloaded 608 KB
 
essai de l'URL 'https://pbil.univ-lyon1.fr/CRAN/src/contrib/Rcmdr_2.3-0.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 5150623 bytes (4.9 MB)
downloaded 4.9 MB
 
ERROR: dependency 'zoo' is not available for package 'sandwich'
* removing 'C:/Users/Documents/R/win-library/3.3/sandwich'
ERROR: dependency 'lme4' is not available for package 'pbkrtest'
* removing 'C:/Users/Documents/R/win-library/3.3/pbkrtest'
ERROR: dependencies 'pbkrtest', 'quantreg' are not available for package 'car'
* removing 'C:/Users/Documents/R/win-library/3.3/car'
ERROR: dependencies 'car', 'sandwich', 'colorspace', 'e1071', 'readxl' are not available for package 'RcmdrMisc'
* removing 'C:/Users/Documents/R/win-library/3.3/RcmdrMisc'
ERROR: dependencies 'RcmdrMisc', 'car' are not available for package 'Rcmdr'
* removing 'C:/Users/Documents/R/win-library/3.3/Rcmdr'
 
Les packages source téléchargés sont dans
        ‘C:\Users\AppData\Local\Temp\RtmpcHbl5f\downloaded_packages’
Warning messages:
1: l'exécution de la commande '"C:/PROGRA~1/R/R-33~1.1/bin/x64/R" CMD INSTALL -l "C:\Users\Documents\R\win-library\3.3" C:\Users\MARIED~1\AppData\Local\Temp\RtmpcHbl5f/downloaded_packages/sandwich_2.3-4.tar.gz' renvoie un statut 1 
2: In install.packages(NULL, .libPaths()[1L], dependencies = NA, type = type) :
  l'installation du package ‘sandwich’ a eu un statut de sortie non nul
3: l'exécution de la commande '"C:/PROGRA~1/R/R-33~1.1/bin/x64/R" CMD INSTALL -l "C:\Users\Documents\R\win-library\3.3" C:\Users\MARIED~1\AppData\Local\Temp\RtmpcHbl5f/downloaded_packages/pbkrtest_0.4-6.tar.gz' renvoie un statut 1 
4: In install.packages(NULL, .libPaths()[1L], dependencies = NA, type = type) :
  l'installation du package ‘pbkrtest’ a eu un statut de sortie non nul
5: l'exécution de la commande '"C:/PROGRA~1/R/R-33~1.1/bin/x64/R" CMD INSTALL -l "C:\Users\Documents\R\win-library\3.3" C:\Users\MARIED~1\AppData\Local\Temp\RtmpcHbl5f/downloaded_packages/car_2.1-3.tar.gz' renvoie un statut 1 
6: In install.packages(NULL, .libPaths()[1L], dependencies = NA, type = type) :
  l'installation du package ‘car’ a eu un statut de sortie non nul
7: l'exécution de la commande '"C:/PROGRA~1/R/R-33~1.1/bin/x64/R" CMD INSTALL -l "C:\Users\Documents\R\win-library\3.3" C:\Users\MARIED~1\AppData\Local\Temp\RtmpcHbl5f/downloaded_packages/RcmdrMisc_1.0-5.tar.gz' renvoie un statut 1 
8: In install.packages(NULL, .libPaths()[1L], dependencies = NA, type = type) :
  l'installation du package ‘RcmdrMisc’ a eu un statut de sortie non nul
9: l'exécution de la commande '"C:/PROGRA~1/R/R-33~1.1/bin/x64/R" CMD INSTALL -l "C:\Users\Documents\R\win-library\3.3" C:\Users\MARIED~1\AppData\Local\Temp\RtmpcHbl5f/downloaded_packages/Rcmdr_2.3-0.tar.gz' renvoie un statut 1 
10: In install.packages(NULL, .libPaths()[1L], dependencies = NA, type = type) :
  l'installation du package ‘Rcmdr’ a eu un statut de sortie non nul

Ensuite j'ai essayé d'installer les packages car, lme4, zoo, sandwich etc. un par un mais ils ne s'installent pas non plus. Ça me met des erreurs.

Y a-t-il quelqu'un qui aurait une solution ?

Merci

[A. D.]

Bonjour,

Cela peut être dû au fait que vous n'utilisez pas la dernière version de R.
Pouvez-vous tenter de mettre R à jour, puis retenter l'installation de "Rmcdr" ?

HTH !


Cordialement,


A.D.

[Marims]

Bonjour,

J'ai désinstallé et réinstallé R (version 3.3.1), mais j'ai toujours le même souci.
En revanche, lorsque je télécharge les packages directement sur le CRAN et que je les dé-zippe moi-même, il n'y a pas de problème donc je pense que je vais continuer à installer le reste des packages de cette façon.

Cordialement,

[Marims]

Bonjour,

J'ai réessayé aujourd'hui, et je n'ai eu aucun problème d'installation. Je ne sais pas d'où ça venait, mais maintenant ça marche

Merci

[lerpinez]

Hello,

Il se trouve que je m'arrache en ce moment les cheveux à cause d'un problème similaire pour installer RCommander, avec des erreurs de dépendance et un message indiquant un "statut de sortie non nul". Un truc comme ça :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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ERROR: dependency ‘car’ is not available for package ‘RcmdrMisc’
* removing ‘/home/marie-christine/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/RcmdrMisc’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘RcmdrMisc’ had non-zero exit status
ERROR: dependencies ‘RcmdrMisc’, ‘car’ are not available for package ‘Rcmdr’
* removing ‘/home/marie-christine/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/Rcmdr’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘Rcmdr’ had non-zero exit status
 
The downloaded source packages are in
        ‘/tmp/RtmpHTXZXF/downloaded_packages’

Et donc, si je peux me permettre de me greffer à la discussion telle une bernique sur la coque d'un galion, je me demandais comment vous aviez fait au final pour installer le package RCommander sans passer par la console de RStudio. Vous vous souvenez de la manip ?

Merci de votre attention,

lerpinez