Discussion :

[romainmill]

Bonjours tous le monde!

J'essaye d'ecrire un code python qui permet d'ouvrir et d'extraire les variables val, x et y d'un fichier xml de la forme suivante:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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<nrml>
     <gmfSet>
             <gmf IMT="PGA">
<node val="0.108820054424" x="-1.45899321606" y="-78.9910038674"/>
<node val="0.110349940564" x="-1.46798643212" y="-78.9910038314"/>
<node val="0.110600507769" x="-1.45899321606" y="-78.9820077349"/>
.
.
.

A terme j'aimerai pouvoir stocker les 3 variables dans 3 vecteurs colonne séparé
Je suis vraiment débutant en xml et j'ai du coup essayer le classique ElementTree method:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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import xml.etree.ElementTree as ET
tree = ET.parse('myfile.xml')

Mais je n'arrive pas du tout a avoir accés aux différentes variables...

J'ai aussi essayé le minidom

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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DOMTree = xml.dom.minidom.parse('myfile.xml')
collection = DOMTree.documentElement
collection.hasAttribute('val')

Mais cela ne me renvoie rien...

Est-ce que vous auriez des conseils a me donner pour ouvrir ce genre de xml ? J'ai essayé de voir un peu tous ce que je pouvais sur le web (stack overflow and co), mais cela n'est jamais vraiment clair, et je suis un peu largué. Au depart j'utilisais la fonction matlab xml2struct.m, savez vous si il existe quelque chose de similaire en python?

[marco056]

Il y a quelques temps, j'avais fait un truc du genre qui marchait à base de beautifulsoup, je crois.

[plxpy]

Bonjours tous le monde!
...

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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import xml.etree.ElementTree as ET
tree = ET.parse('myfile.xml')

Mais je n'arrive pas du tout a avoir accés aux différentes variables...
...

Tu as vite abandonné !
La doc est pourtant bien faite et pleine d'exemples.

Méthode findall avec un Xpath bien senti pour récupérer les éléments puis exploitation de l'attribut attrib, et le tour est joué.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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>>> tree = ET.parse('myfile.xml')
>>> for node in tree.findall('.//node'):
...     print node.attrib
... 
{'y': '-78.9910038674', 'x': '-1.45899321606', 'val': '0.108820054424'}
{'y': '-78.9910038314', 'x': '-1.46798643212', 'val': '0.110349940564'}
{'y': '-78.9820077349', 'x': '-1.45899321606', 'val': '0.110600507769'}
>>>

[romainmill]

Merci Marco056!

En effet le module BeautifulSoup est super efficace! J'ai pu extraire les variables facilement depuis mon fichier xml!

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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from bs4 import BeautifulSoup
import csv
import numpy as np
import pylab as pl
 
soup = BeautifulSoup (open("myfile.xml"))
 
Val=[]
X=[]
Y=[]
 
links = soup.find_all('node')
 
for link in links:
   #print link
   val = link.get('gmv')
   Val.append(float(val))
   x = link.get('x')
   X.append(float(x))
   y = link.get('y')
   Y.append(float(y))

Du coup je ne sais pas si c'est le plus efficace, mais ca marche!