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ImageJ Java Discussion :

fonction imageJ converti en python ?


Sujet :

ImageJ Java

  1. #1
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    Par défaut fonction imageJ converti en python ?
    Bonjour,

    J'ai plusieurs questions plus ou moins précises :

    1) Comment peut-on utiliser/convertir une fonction imageJ ou d'un de ses plugins dans un programme (pour mon cas Python) ?

    2) Est-il possible d'appeler une macro dans un programme ?

    3) Cas particulier :
    Je cherche à développer un outil qui calcule une matrice de rotation puis qui applique cette rotation sur des images 3D.
    J'ai trouvé les fonctions "translate" et "rotate" du plugin TransformJ. Même si cette fonction implique de calculer à partir de ma matrice de rotation les 3 angles en x, y et z ; elle permet surtout de faire facilement différentes interpolations.
    Le problème est que je ne peux pas installer imageJ sur le serveur (je n'ai pas les droits pour ça) et encore moins le plugin.

    Y a-t-il un moyen d'utiliser cette fonction hors imageJ dans un programme python ? Ça peut m'être utile à l'avenir pour d'autres fonctions aussi

    4) Pour mon cas particulier, mon plan B est d'utiliser cet algo, qui me permet d'utiliser la matrice de rotation directement. J'ai cherché comment je pourrai inclure et gérer les interpolations de mes images 3d, et je n'arrive vraiment pas à voir comment je peux faire. Tout ce que je trouve c'est pour des coordonnées ou des courbes ; pas pour des images 3d (je ne vois pas comment je peux utiliser la fonction "interpolate" de la documentation)

  2. #2
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    Personne n'a d'idée pour ne serait-ce qu'une seule de mes 4 questions ?

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