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Bioinformatique Perl Discussion :

programme blast code source


Sujet :

Bioinformatique Perl

  1. #1
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    bonjour,
    je veux le programme Blast ou un programme d'alignement locale de séquence en C ou C++.
    est-ce que vous pouvez m'aider?
    merci

  2. #2
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    Par défaut
    Je ne fais pas de biologie ni de génétique en Perl, mais pour Blast/Bioperl, jette déjà un coup d'oeil à ces liens:

    http://www.bioperl.org/wiki/BLAST

    http://www.bioperl.org/wiki/Main_Page

  3. #3
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    j'ai besoin en code source en C si c'est possible.
    car je programme en C.

  4. #4
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    Par défaut
    Dans ce cas, je crains que tu ne sois pas sur la bonne rubrique du forum!

    Non pas que l'on refuse de t'aider, mais je doute que quiconque ici fasse de l'alignement de séquence en C.

    Essaie la rubrique C du site, mais tu n'y trouveras peut-être pas beaucoup de biologistes....

  5. #5
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    Par défaut
    Tu ne peux pas utiliser l'interface web du NCBI ?
    Il me semble que j'avais programmé en perl le traitement de requêtes au serveur à l'aide de WWW::Mechanize

    Mais ça ne répond pas directement à ta question.
    En tout cas, je ne vois guère l'intérêt de programme en C/C++ des applications bio de gestion de génome... vu la puissance expressive de perl et la modulographie disponible dans ce domaine.
    Plus j'apprends, et plus je mesure mon ignorance (philou67430)
    Toute technologie suffisamment avancée est indiscernable d'un script Perl (Llama book)
    Partagez vos problèmes pour que l'on partage ensemble nos solutions : je ne réponds pas aux questions techniques par message privé
    Si c'est utile, say

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