IdentifiantMot de passe
Loading...
Mot de passe oublié ?Je m'inscris ! (gratuit)
Navigation

Inscrivez-vous gratuitement
pour pouvoir participer, suivre les réponses en temps réel, voter pour les messages, poser vos propres questions et recevoir la newsletter

ImageJ Java Discussion :

ImageJ Pile, Alignement, Applatissement, Superrésolution


Sujet :

ImageJ Java

  1. #1
    Membre à l'essai
    Homme Profil pro
    Stagiaire
    Inscrit en
    Juillet 2015
    Messages
    4
    Détails du profil
    Informations personnelles :
    Sexe : Homme
    Âge : 31
    Localisation : France, Bouches du Rhône (Provence Alpes Côte d'Azur)

    Informations professionnelles :
    Activité : Stagiaire
    Secteur : Enseignement

    Informations forums :
    Inscription : Juillet 2015
    Messages : 4
    Par défaut ImageJ Pile, Alignement, Applatissement, Superrésolution
    Bonjour,

    Etant débutant sur ImageJ, j'ai plusieurs questions :

    Pour faire de la super résolution il est nécessaire que tous les slices soient alignés, ce qui se fait bien avec le plugin Template_Matching... si l'objet n'est pas trop en rotation sur lui même (je pense être dans un cas limitrophe). Mes slices étant déjà des x4 des originaux, pas besoin de les aggrandir. Enfin pour applatir l'image, j'utilise la fonction Z-project de Image>Stack, avec une moyenne sur l'intensité de chaque image (8-bit, échelle de gris). Cependant mon résultat est pour ainsi dire quasiment le même que toutes les images de bases.

    Sinon j'ai trouvé un plugin intéressant (Parallel Super Resolution), mais lorsque je lui demande de travailler sur ma pile, il me renvoie un log "java.outofmemoryerror", dois je comprendre que mon image est trop "grosse" (8000 * 8000)


    En vous remerciant pour l'attention que vous me porterez,

    Respectueusement.

  2. #2
    Membre éprouvé Avatar de Tchoukatroc
    Homme Profil pro
    Soupière
    Inscrit en
    Mai 2014
    Messages
    99
    Détails du profil
    Informations personnelles :
    Sexe : Homme
    Localisation : France, Hauts de Seine (Île de France)

    Informations professionnelles :
    Activité : Soupière
    Secteur : Santé

    Informations forums :
    Inscription : Mai 2014
    Messages : 99
    Par défaut
    Bonjour,

    Oui, peut être que ton image est trop grosse. Tu peux augmenter la quantité de mémoire vive allouée à imageJ dans les préférences (il me semble que de base, imageJ à 2Gb de RAM alloué ce qui est rapidement insuffisant pour de gros stack).

  3. #3
    Membre à l'essai
    Homme Profil pro
    Stagiaire
    Inscrit en
    Juillet 2015
    Messages
    4
    Détails du profil
    Informations personnelles :
    Sexe : Homme
    Âge : 31
    Localisation : France, Bouches du Rhône (Provence Alpes Côte d'Azur)

    Informations professionnelles :
    Activité : Stagiaire
    Secteur : Enseignement

    Informations forums :
    Inscription : Juillet 2015
    Messages : 4
    Par défaut
    Re,

    Merci de la réponse.
    Effectivement l'image était trop grosse, mais, avec des échantillons 256*256 de l'image, j'ai un tout autre problème. L'alignement est bof, mais surtout le procédé de super résolution est étrange , sur des templates, images basiques, tout marche bien, mais sur mon image, elle est en sortie plus foncée qu'en entrée, sans vraiment d'amélioration.
    Que faire ? Connaissez vous un meilleur moyen de procéder ? ( Normalized convolution ? Matlab? ...)

    Respectueusement,

  4. #4
    Modérateur
    Avatar de ToTo13
    Homme Profil pro
    Chercheur en informatique
    Inscrit en
    Janvier 2006
    Messages
    5 793
    Détails du profil
    Informations personnelles :
    Sexe : Homme
    Âge : 46
    Localisation : Etats-Unis

    Informations professionnelles :
    Activité : Chercheur en informatique
    Secteur : Santé

    Informations forums :
    Inscription : Janvier 2006
    Messages : 5 793
    Par défaut
    Pour l'alignement/registration, il y a le plugin StackReg qui fonctionne très bien. Teste différents types d'alignements, car on pense toujours que la déformation est juste une translation, mais c'est souvent faux.

    Les fonction de z-projection d'ImageJ sont juste aussi basiques que mauvaises. Il existe un plugin nommé "extended depth of field" développé par des chercheurs de l'EPFL qui fonctionne très bien. C'est basé sur les ondelettes, donc parfois l'algorithme introduit un petit halo autour des structures.
    Consignes aux jeunes padawans : une image vaut 1000 mots !
    - Dans ton message respecter tu dois : les règles de rédaction et du forum, prévisualiser, relire et corriger TOUTES les FAUTES (frappes, sms, d'aurteaugrafe, mettre les ACCENTS et les BALISES) => ECRIRE clairement et en Français tu DOIS.
    - Le côté obscur je sens dans le MP => Tous tes MPs je détruirai et la réponse tu n'auras si en privé tu veux que je t'enseigne.(Lis donc ceci)
    - ton poste tu dois marquer quand la bonne réponse tu as obtenu.

Discussions similaires

  1. Boutons pas alignés pile poil
    Par sopsag dans le forum Tkinter
    Réponses: 2
    Dernier message: 16/04/2009, 10h07
  2. JBuilder7 & JTable Colonne alignement
    Par Tonton Luc dans le forum JBuilder
    Réponses: 5
    Dernier message: 06/11/2002, 17h32
  3. [Datareport] Alignement
    Par SpaceFrog dans le forum VB 6 et antérieur
    Réponses: 2
    Dernier message: 05/11/2002, 11h53
  4. [VB6] [Printer] Chiffres alignés à droite
    Par Laye dans le forum VB 6 et antérieur
    Réponses: 7
    Dernier message: 03/10/2002, 18h36
  5. [TASM] Déclarer le segment de pile
    Par cipher dans le forum x86 16-bits
    Réponses: 2
    Dernier message: 01/10/2002, 03h58

Partager

Partager
  • Envoyer la discussion sur Viadeo
  • Envoyer la discussion sur Twitter
  • Envoyer la discussion sur Google
  • Envoyer la discussion sur Facebook
  • Envoyer la discussion sur Digg
  • Envoyer la discussion sur Delicious
  • Envoyer la discussion sur MySpace
  • Envoyer la discussion sur Yahoo