Bonjour,
je cherche un moyen d'obtenir des informations sur mes snp en ne connaissant QUE la position et le changement de nucléotide
Pas le NOM/ID/AssessionNB ou quoi que soit d'autre. Juste chr1:123456 A T/C
Avec cela, j'aimerai connaître le nom du gène (SYMBOL HUGO), ainsi que la localisation (intronique, exonique, UTR, ...) et les coordonées de type coding (c.12A>T) et protein (p.178Lys>Met).
Jusqu'à présent, j'utilisais R. Je voudrai savoir s'il y a un moyen de faire cela en perl, avec BioPerl peut-être? Obtenir la position depuis un id de gène est la seule chose que j'ai trouvé.
Quelqu'un aurai une piste?
Merci!
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