J'ai quasi réussi à régler tout mes problèmes, il m'en reste 2.
De plus, certaines dll ne fonctionnent pas : le service ne démarre pas si je les sélectionne. Mais bon, les pages php ont l'air de fonctionner en les désactivant.
1er problème :
J'ai eu cette erreur lors du démarrage de MySQL :

Je ne l'ai eu qu'une seule fois et le service a pourtant bien démarré 
2ème problème:
J'essaie d'installer Pear ainsi que son package OLE (utilisé par l'application actuellement en place). Pear semble installé correctement par contre j'ai de gros doutes pour OLE.
Pour info, j'ai fait la partie suivante avant d'arriver à installer OLE. Donc il manque peut être des fichiers.
En tout cas j'ai copié les fichiers OLE.php, PPS.php et le répertoire PPS (File.php + Root.php) de l’ancienne version de « wamp » vers la nouvelle : répertoire « E:\wamp\bin\php\php5.4.16\pear »
Il faut alors modifier dans la page « E:\WEB\SMEP\class\Excel\reader.php » pour ne pas avoir l’erreur suivante :
require_once(OLE.php): failed to open stream: No such file or directory in E:\WEB\SMEP\class\Excel\reader.php on line 33
Il m'a suffit de modifier la ligne concernée dans la page php pour mettre à jour le nom du répertoire.
set_include_path(get_include_path() . ";E:\wamp\bin\php\php5.4.16\pear");
Je n'ai alors plus d'erreur
Sinon j'ai récupéré l'archive OLE ici : http://pear.php.net/package/OLE/download/1.0.0RC2/
J'ai passer la commande suivante : « pear install OLE-1.0.0RC2 »
Cela crée les fichiers dans le répertoire « E:\wamp\bin\php\php5.2.6 » qui correspond à l'ancienne version de php.
Alors que ma nouvelle version est dans « E:\wamp\bin\php\php5.4.16 ».
Savez-vous d'où vient ce problème ?
Une fois des explications sur ces 2 problème, je pourrais passer le sujet en résolu
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