Discussion :

[keaton84]

Bonjour tout le monde,

En utilisant R de manière intelligente (si possible sans boucles) , j'aimerais calculer des matrices de proba de transition à partir d'un historique de notations. Si on considère la notation comme une variable aléatoire discrète définie sur un support fini, on peut considérer que le processus suit une chaine de Markov à temps discret.

Mes données se présentent comme suit :

-Un tableau à deux entrées de taille [(N+1) x (M+1)]
-Colonne 1 : la liste des individus de mon étude
-Ligne 1 : les dates d'observation
-L'ensemble des notations = {1,2,...,8}
J'ai mis un exemple en PJ

Les matrices de transition peuvent être calculées entre des périodes qui se suivent (entre Date1 et Date2 par exemple) mais aussi entre des périodes non voisines.

Dites moi si ma question n'est pas claire.

Merci d'avance

Réda

[Americano]

Bonjour,
Il existe déjà un package qui traite des matrices de transition.
Tu peux le télécharger ici:

http://cran.fhcrc.org/web/packages/m...ain/index.html

Et ici, tu as le guide:

http://cran.r-project.org/web/packag...arkovchain.pdf

En y fouillant un peu, tu pourras trouver ce que tu cherches.
Merci

[keaton84]

Salut Americano,

c'est un package que je connais déjà, je l'ai parcouru et honnêtement je n'ai pas eu l'impression qu'il répondait à ma demande.

J'ai trouvé la fonction MarkovchainFit qui fait la construction des matrices de transition à partir d'une séquence d'états, je vais tenter de creuser le truc pour voir si je peux transformer mon historique en ce genre de séquence...

Au pire, j'relève les manches et j'recode le truc seul comme à l'ancienne

A+

[yani50]

Bonjour,

Je suis confronté à un problème : je veux construire les matrices de Markov (transition et émission) à partir des données (variables) sous format Excel, mais je ne trouve pas des fonctions dans matlab (ou autres logiciel) qui me permettent de générer ces matrices d'une manière automatique. Pouvez-vous m'aider, me proposer des outils, des méthodes, etc. ?

Exemple de tableau sous Excel :

temps var1 var 2 var3 var4 var 5

1 10 30 1 40 2

2 0.25 100 11 12 15

3 45 20 49 74 80

4 1 85 69 85 3



Quel outil permet de générer les matrices de Markov à partir de ce tableau ?

Merci à l'avance.

Cordialement