Discussion :

[fabricen26]

Salut à vous,

Sur Windows, pour installer un package, on peut aller le copier sur dans dossier C:\Program Files\R\R-3.0.2\library et le coller dans le même répertoire sur la machine où l'on désire l'installer et cela fonctionne très bien.

J'aimerais savoir si cette technique est possible sur Ubuntu. Si oui, dans quel dossier je devrais aller pour copier ces packages ?
Merci d'avance de votre aide.

[tomaprice]

Je te déconseille la technique du copié/collé, ca aboutit souvent à des packages non fonctionnels.

Il y a deux solutions :

Si ton package provient des dépôts R :
Dans une cession R tu utilises la fonction install.packages("le_nom_de_ton_package") qui va installer ton package ainsi que toutes les dépendances.

Si tu as téléchargé manuellement ton package alors :
dans un terminal : R CMD INSTALL le_chemin_vers_ton_package

[ced]

Une manière simple de faire ça consiste, dans R sur la machine Windows, à exporter dans un fichier texte la liste des packages installés avec la commande :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

write.csv(installed.packages()[, "Package"], "packages.csv", row.names = F)

Sur la machine Ubuntu, il suffit d'importer cette liste, de la comparer à la liste des packages installés sur la machine, puis d'installer la différence :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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list.packages <- read.csv("packages.csv", header = FALSE)
new.packages <- list.packages[!(list.packages %in% installed.packages()[, "Package"])]
install.packages(new.packages)

[ced]

Je viens de tester mon code (passage à R 3.1.0) et il se trouve qu'il y a un tout petit bug...
En effet, new.packages se trouve être un data frame à une colonne, et la fonction d'installation attend un vecteur, on résout donc le problème avec le code suivant :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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list.packages <- read.csv("packages.csv", header = FALSE)
new.packages <- list.packages[!(list.packages %in% installed.packages()[, "Package"])]
install.packages(new.packages[,1])