Tu copie-colle tes <link> et tes <script> dans le <head> de tes autres pages, pareil que dans index.php (il faut naturellement que tes autres pages soient placées dans le même dossier à côté de ton index.php)
Je vais essayer de te décripter :
<link href="css/bootstrap.min.css" rel="stylesheet" type="text/css">
Dans ce link par exemple que tu places sur une de tes pages, le href va chercher un fichier. Dans cette exemple, il va chercher dans le dossier "css" le fichier "bootstrap.min.css". C'est pour ça qu'il est important de bien placer ses fichiers.
Donc dans ton dossier qui contient "index.php" (et tes autres pages.php ou .html) il y aussi dedans un dossier "css" qui contient le fichier "bootstrap.min.css". Il faut toujours suivre une route dans l'arborescence de ton site.
C'est comme ça que je fais, après tu peu nommer tes fichier et tes dossiers comme tu veux, mais il faut bien mettre la même chose dans ton code html.
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