Discussion :

[benj.che]

Bonjour,

Est il possible de faire une anti jointure sur R?
Par exemple si j'ai 2 tables: tabA et tabB et que je souhaite faire une jointure par "id" si les observations sont dans tabA mais pas dans tabB

Avec SAS in tabA and not in tabB

Merci

[Sengar]

Salut,

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

setdiff(tabA$id,tabB$id)

Renvoit ce qui est dans tabA et pas dans tabB

Apres le reste de ce que tu veux faire n'est pas clair.

[benj.che]

Mais la fonction setdiff() me donne seulement les élément identique des 2 tables...

[benj.che]

Ce que je veux faire c'est une anti jointure de 2 tables.

Par exemple si j'ai:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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tabA = data.frame(id=c(1,2,3),nom=c("a1","a2","a3"))
tabB = data.frame(id=c(1,2,4),prenom=c("b1","b2","b4"))

Je veux faire la jointure en conservant uniquement les observations présentes dans tabA et pas dans la tabB, c'est-à-dire que le résultat ici serait

id nom prénom
3 a3 NA

[Sengar]

Mais la fonction setdiff() me donne seulement les élément identique des 2 tables...

Non, lance la fonction tu verras.

je veux faire la jointure en concervant uniquement les observations présentes dans tabA et pas dans la tabB, c'est à dire que le résultat ici serait

setdiff est bien approprié.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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m<-merge(tabA, tabB,all.x=TRUE)
m[m$id %in% setdiff(tabA$id,tabB$id),]

Renvoit:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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id nom prenom 
3  a3   <NA>

Par contre j'avoue que j'ai du mal à voir l'interet de faire ca mais bon ^^

[ced]

Sinon, pour faire des jointures ou anti-jointures sur des data.frames, on peut passer par le package data.table (rapide, simple et efficace) :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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library(data.table)
tabA <- data.table(id=c(1,2,3),nom=c("a1","a2","a3"), key="id")
tabB <- data.table(id=c(1,2,4),prenom=c("b1","b2","b4"), key = "id")
tabA[!tabB]

La seule différence avec ce que vous souhaitez, c'est que ça ne renvoie pas la colonne "prenom", ce qui n'est d'ailleurs pas utile vu qu'elle est toujours vide.