Discussion :

[am_003]

Bonjour,
Je vous écris car j'ai une difficulté d'effectuer le comptage des composants connexes dans une image.
A partir d'une image (scan), j'ai effectué un seuillage à 90 qui me parait adéquat (car le seuillage inférieur à 90 donne des contours non fermés, et supérieur à 90 donne des bruits dans l'image).
J'ai ensuite fait l'étiquetage en composantes connexes, cela m'a donné 120 objets au lieu de 145 (j'en suis pas loin)
Ceci est dû au fait que les contours ne sont pas totalement fermés, pour cela je n'arrive pas à atteindre le nombre exact des objets.
J'ai tenté une autre technique, (Seuillage->ouverture (érosion puis dilatation) -> Étiquetage), ceci m'a donné une image avec des contours fermés mais avec des bruits au milieu des objets, le comptage maintenant donne 200 puisqu'il prend en compte les petits objets (bruits crées en raison de l'ouverture).
Je ne sais pas que faire maintenant, pour cela je vous sollicite de me donner de l'aides et conseils ..

[ToTo13]

Bonsoir,

est ce que l'on pourrait avoir quelques images d'exemple pour savoir ce que l'on doit traiter/trouver/compter/etc.

PS :
- une image vaut 1000 mots
- c'est un problème de méthodologie et non d'ImageJ, donc le message va être déplacé.

[am_003]

J'ai mis l'image de départ ci-joint.
Après les images binaires (issues de seuillages+ouvertures) sont sous formats .pgm et je n'arrive pas à les attacher ci-joint.
Je vous remercie.

[ToTo13]

As tu essayé un filtre alterné séquentiel ?

Ce genre d'image correspondrait bien à un watershed stochastic, mais il faudrait de nombreuses itérations pour être certain de trouver les petites composantes.

Sinon je testerai les érodés ultimes.

[am_003]

Je te remercie pour ta réponse.
Je ne sais pas c'est quoi un "filtre alterné séquentiel".
Pour "l'érodés ultimes", il faut le faire un seuillage avant ?
Image après seuillage à 90 (Image-2).
Voilà j'ai fait un érodés ultimes après un seuillage à 90 (Image-3).
J'ai fait un à 90 seuillage puis une érosion puis une dilatation (Image-4), ce résultat m'arrange mieux car j'ai réussi à fermer les contours, mais par contre le souci c'est que cela a généré des petits particules qui sont comptés comme des composantes lors de l'étiquetage ..

[ToTo13]

Pour le filtre alterné séquentiel, fais une recherche.

L'érodé ultime pourrait te donner un bon résultat avec un seuillage bas, mais il faut toujours utiliser la notion de seuil qui est ennuyeuse pour la généralisation.
En revanche, je viens de relire mes cours de morphomath et l'ouverture ultime (ultimate opening) s'applique très bien à ton cas. Tu peux même faire une reconstruction de tes résidus afin de schématiser le centre des morceaux..