Discussion :

[Jasmine80]

Bonjour à tous,


Voici mon problème ... avec la super rénovation du système informatique, je ne suis plus administratrice de mon PC ... de ce côté, vous ne pouvez pas faire grand chose allez-vous me dire!

J'essaie donc de contourner les problèmes. En dernier recours, j'irai ennuyer le helpdesk. Je retrouve avec ClustalW le même problème que précédemment avec Blast : mon module perl n'arrive pas a accéder à mon exécutable car le chemin contient un espace. J'avais solutionné le problème en changeant le répertoire de l'exécutable, afin de supprimer les espaces, mais je n'en ai plus le droit maintenant.

Djibril m'avait conseillé d'utiliser chdir, je me tourne donc vers cette solution.

Voici la localisation de mon exécutable : C:/Program Files/Clustalw2/clustalw2.exe

1)Dois-je utiliser ce répertoire comme lieu de travail et faire un chdir('C:/Program Files/Clustalw2/clustalw2.exe') en tout début de programme?

2) perldoc : chdir EXPR : Changes the working directory to EXPR, if possible.
... que sous-entend le 'if possible'?

3) que mettre à la ligne :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

$factory->executable("C:/Program Files/Clustalw2/clustalw2.exe");

... dois-je simplement la supprimer?

Merci pour votre aide,

[Lolo78]

2) perldoc : chdir EXPR : Changes the working directory to EXPR, if possible.
... que sous-entend le 'if possible'?

S'il existe, par exemple, ou si tu as les privilèges suffisants pour y accéder.

[Gardyen]

je dirais plutôt

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
chdir('C:/Program Files/Clustalw2/');
$factory->executable("clustalw2.exe");

[nibroc]

Bonjour,
Peut-être peut-on contourner le problème en utilisant les noms courts :
"C:/Program Files/Clustalw2/clustalw2.exe"
doit pouvoir s'écrire :
"C:/Progra~1/Clustalw2/clustalw2.exe"
ou
"C:/Progra~2/Clustalw2/clustalw2.exe"
ou ....
on trouve le bon numéro en comparant le contenu de Program Files
avec celui de progra~1 puis de progra~2 etc. en utilisant la commande chdir
dans une fenêtre de commande cmd

[Jasmine80]

je dirais plutôt

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
chdir('C:/Program Files/Clustalw2/');
$factory->executable("clustalw2.exe");

... oui, c'est logique ^^


Merci cela fonctionne, je vais garder cette solution pour le moment. Merci à vous 2 pour vos conseils.