Discussion :

[selver057]

Bonsoir,

Je dois lire avec R les données stockées dans un fichier au format texte (.txt). Ce fichier contient 11 colonnes de données et le nom de certaines colonnes occupe les 2 premières lignes. Pour le moment j'ai les commandes suivantes :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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chemin<-"http://chemin pour accéder au fichier"
donnees<-read.table(paste(chemin,"nom_fichier.txt",sep=""),header=T)
donnees

Je n'arrive pas à récupérer les données, il y a un message d'erreur qui s'affiche :

Erreur dans scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings, :
la ligne 2 n'avait pas 13 éléments

Clairement, le problème se situe au niveau des 2 premières lignes, celles contenant les noms de colonne. Pouvez-vous, s'il vous plaît, m'indiquer une solution? D'avance je vous remercie pour votre(vos) réponses(s).

[ced]

Bonjour,

Sans voir un exemple des premières lignes du fichier de données, pas facile de faire au mieux...
Une solution consiste à indiquer que le fichier ne contient pas les noms des colonnes et de dire à R de sauter les 2 premières lignes :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

donnees<-read.table(paste(chemin,"nom_fichier.txt",sep=""),header=F, skip = 2)

Ensuite, il faudra renommer les colonnes du data frame obtenu avec la fonction names().

[Jesk34]

Ah oui, j'avais pas pensé au skip. Bonne idée.

Cela peut venir de plusieurs choses :
Le système de décimale utilisé ( par défaut R met un ".", regarde si ton tableau ne fonctionne pas à "," typiques des français)

+ d'autres choses mais sans voir le jeu de données, c'est pas évident

Je te conseille la procédure suivante :
enregistre ton fichier en csv (séparateur ; )
puis :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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x<-choose.files()
donnees<-read.csv(x,header= T, dec=".",sep=";")

Si tu as des données vides tu peux rajouter
na="NA" parce que R ne sait pas gérer.

[selver057]

Bonjour,
Merci beaucoup pour vos réponses. Voici en fichier joint un exemple de fichier que j'utilise. Employer "skip" pour enlever les deux premières lignes (celles des en-têtes) est effectivement une solution pratique. Pouvez-vous me donner un exemple de l'utilisation de "names()" pour récupérer par la suite les en-têtes enlevés auparavant ?

[ced]

Il est préférable d'éviter les espaces et les accents dans les noms de colonnes d'un data frame sous R.
Du coup, après l'import des données, vous pouvez toujours renommer les colonnes comme suit :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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donnees <- read.table(paste(chemin,"nom_fichier.txt",sep=""),header=F, skip = 2)
names(donnees) <- c("semaine", "magasin1", "magasin2", "temps", "scolaire", "laitier", "fruits", "parfum", "boisson", "epicerie", "textile")

C'est un exemple, à vous de l'adapter à votre convenance.

[MMDM12]

Bonjour,
peut-être qu'il faudrait aussi que tu regardes ta deuxième ligne :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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Semaine magasin   magasin   type de  fournitures produits fruits & parfumerie boissons epicerie textile 
           1         2       temps    scolaires  laitiers  legumes

elle n'est pas bien structurée.
Il faut juste la re-arranger et dans read.tablen'oublie pas de mettre dec="," .

[namby91]

Ton problème vient à mon avis des espaces dans les noms des colonnes.
J'ai eu le même problème avec un fichier ayant des tabulations comme séparateur de colonnes et des retour-chariot comme fin de ligne.
Mais il m'a pris en compte les espaces comme des tab, ce qui fait que certaines lignes comprenaient,selon R, plus de colonnes que la première ligne, car j'avais des espaces dans certaines cellules du tableau.
J'ai mis un underscore à la place des espaces et tout s'est bien passé ensuite.
Je précise que je suis sous Mac, je ne sais pas si ce bug est spécifique à cette version.