Discussion :

[abdel1342]

* Bonjour *

Je réalise à partir d'un tableau de données une matrice sur laquelle je fais un clustering ... Et je voudrais récupérer une liste ordonnée selon l'ordre du clusturing.

Avec ou après l'étape du hclust.

En bref, je veux obtenir à partir de cet arbre par exemple (l'image):



une liste de ce genre:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
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4
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6
7
8
9
 
GHI
JKL
ABC
PQR
VWX
DEF
STU
MNO

Une autre question : est-il possible d'afficher l'arbre dans le sens qu'on veut? Car quand je fais le hclust, l'arbre est toujours dans ce sens:


Et moi je voudrais l'afficher en sortie dans le sens que je montre en 1er ou son miroir.

* Merci. *

[A. D.]

Bonjour,

Pour obtenir l'aide d'une fonction, vous pouvez faire :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

?hclust

Je me suis basée sur l'exemple présent dans cette aide pour trouver les réponses à vos questions :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
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7
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9
10
require(graphics)
hc<-hclust(dist(USArrests),"ave")
plot(hc)
 
# éléments contenus dans "hc" :
 
names(hc)
 
[1] "merge"       "height"      "order"       "labels"      "method"     
[6] "call"        "dist.method"

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
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5
6
7
8
9
 
# liste que vous souhaitez obtenir :
 
hc$labels[hc$order]
 
 
# changer le sens du graphique :
 
plot(as.dendrogram(hc),horiz=TRUE)

Après il faut sûrement jouer sur les marges de la fenêtre graphique etc pour ajuster le graphe selon vos souhaits.


Cordialement,

A.D.

[abdel1342]

Merci beaucoup pour cette réponse.

Très claire et très intuitive.

Merci encore une fois.