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Shell et commandes GNU Discussion :

grep extraire plusieurs termes en comparant plusieurs fichiers entre eux


Sujet :

Shell et commandes GNU

Vue hybride

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  1. #1
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    Par défaut grep extraire plusieurs termes en comparant plusieurs fichiers entre eux
    Bonsoir à tous,

    Je suis tombée sur une petite ambiguitée, je veux comparer plusieurs fichiers entre eux de telle sorte que :
    J'ai un dossier A de fichiers A que je veux comparer avec le dossier B qui contient les fichiers B par exemple. Telque: le fichierA0 je le comprare avec le fichierB0
    le fichierA1 je le compare avec le fichierB1
    ainsi de suite jusqu'au fichierAn que je compare avec le fichierBn.

    Voilà mon but étant d'éxtraire les termes qui sont dans les fichiersA et qui appartient seulement aux fichiersB car au final je veux travailler avec une liste plus restreinte donc juste me limiter avec les termes qui apparaissent dans les fichiersB.

    Voilà, avec grep : j'ai essayé
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    grep -iwof /home/sabrina/fichiersA/* /home/sabrina/fichiersB/*
    pour dire que je vais comparer chaque fichier A au fichierB en quelque sorte
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    grep -iwof /home/sabrina/fichiersA0.txt /home/sabrina/fichiersB0.txt
    grep -iwof /home/sabrina/fichiersA1.txt /home/sabrina/fichiersB1.txt
    grep -iwof /home/sabrina/fichiersA2.txt /home/sabrina/fichiersB2.txt
    ................................................................................................
    grep -iwof /home/sabrina/fichiersAn.txt /home/sabrina/fichiersBn.txt
    Mais j'ai des résultats bizzards. Je voudrais juste comprendre si c'est correcte ce que j'ai fait ou bien j'ai du mal intrépréter ma problématique sous commande.
    Merci pour vos réponse. Très bonne soirée.

  2. #2
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    Citation Envoyé par sab113 Voir le message
    Voilà, avec grep : j'ai essayé
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    grep -iwof /home/sabrina/fichiersA/* /home/sabrina/fichiersB/*
    pour dire que je vais comparer chaque fichier A au fichierB en quelque sorte
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    grep -iwof /home/sabrina/fichiersA0.txt /home/sabrina/fichiersB0.txt
    grep -iwof /home/sabrina/fichiersA1.txt /home/sabrina/fichiersB1.txt
    grep -iwof /home/sabrina/fichiersA2.txt /home/sabrina/fichiersB2.txt
    ................................................................................................
    grep -iwof /home/sabrina/fichiersAn.txt /home/sabrina/fichiersBn.txt
    Mais j'ai des résultats bizzards. Je voudrais juste comprendre si c'est correcte ce que j'ai fait ou bien j'ai du mal intrépréter ma problématique sous commande.
    Merci pour vos réponse. Très bonne soirée.
    Je ne pense pas que tu puisses faire boucler grep comme ça!
    En fait, dans ta 2ème partie, tu dis assez précisément ce que tu veux faire faire à ton programme. On peut même le prendre comme des spécifications... Et il ne reste plus qu'à le coder!
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    #!/bin/ksh
    # Comparer chaque fichier A au fichier B
    for fichierA in /home/sabrina/fichiersA*.txt ; do
        fichierB=$(echo "${fichierA}" | sed -e 's:fichiersA:fichiersB:')
        grep -iwof "${fichierA}" "${fichierB}"
    done
    HTH
    )jack(
    PS: ton bizzard est très bizarre

  3. #3
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    Par défaut
    Salut,

    Sachant que tu souhaites comparer 2 fichiers A et B pourquoi ne pas utiliser diff dont c'est justement la spécialité (voir le man pour les options).
    Voir aussi comm qui peut afficher les résultat soit commun aux 2 fichiers soit exclusifs à l'un des 2 fichiers.
    Winnt
    Merci de lire les règles du forum LaTeX et Qu'est ce qu'un ECM ?.
    N'hésitez pas à parcourir la FAQ la réponse y est peut-être déjà.
    Pensez au bouton si votre problème est résolu.


    C'est en Linuxant qu'on devient .... geek
    Et c'est en LateXant qu'on devient flemmard
    Mon blog tout neuf.
    Articles : présentation de la distribution Gentoo, Les index sous LaTeX et leur personnalisation.

  4. #4
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    Bonsoir,

    Pouvez vous m'expliquer ce que fait la ligne suivante:
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    fichierB=$(echo "${fichierA}" | sed -e 's:fichiersA:fichiersB:')
    les fichiers B se trouvent dans un autre dossier qui n'est pas spécifié dans cette ligne et j'aimerais comprendre cette ligne sed -e 's:fichiersA:fichiersB:'

    Pour les commandes comm et diff la comande comm compare deux fichiers s'ils sont triés dans mon cas les fichiersA est un ensemble de motifs ou mots chaque ligne et un mot .
    par contre les fichiers B est un ensemble de phrases.
    je veux récupérer les mots qui existent seulement ou bien qui se trouvent seulement dans les phrases des fichiers B.

    Exemple :
    fichier A0 contient :
    Alkylation
    Animals
    Chromatography
    Ethers
    Fish Oils
    Glycerol
    Greenland
    Hydroxylation
    Mass Spectrometry
    Sharks
    le fichier B0 contient:
    1-O-(2-hydroxyalkyl)glycerols isolated from Greenland shark liver oil.

    donc je veux avoir les motifs qe A0 qui sont seulement dans la phrase du fichier B0.

    Le problème c'est qu'avec une collection de fichiers A et une autre collection de fichiers B
    pour moi ça devient plus difficile de formuler que :
    le fichier A0 je le compare seulement au fichier B0.
    le fichier A1 je le compare seulement au fichier B1.
    .......
    le fichier An je le compare seulement au fichier Bn.

    Pourriez vous m'aider svp.
    PS: mon bizzare est devenu normal. ^^

  5. #5
    Rédacteur/Modérateur
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    Par défaut
    Salut,

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    sed -e 's:fichiersA:fichiersB:'
    Dans ce code jack-ft a simplement changer le délimiteur de commande de sed qui traditionnellement est /.
    C'est donc équivalent à
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    sed -e 's/fichiersA/fichiersB/' ou sed -e 's#fichiersA#fichiersB#'
    Ce code demande à sed de substituer le motif fichiersA par le motif fichiersB.
    Winnt
    Merci de lire les règles du forum LaTeX et Qu'est ce qu'un ECM ?.
    N'hésitez pas à parcourir la FAQ la réponse y est peut-être déjà.
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  6. #6
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    Salut,

    Le problème c'est qu'avec une collection de fichiers A et une autre collection de fichiers B pour moi ça devient plus difficile de formuler que...
    Ben justement tout ce qu'il nous manque pour t'aider au mieux c'est le nom exact des fichiers contenus dans A et dans B, ou du moins savoir comment associer le fichier A/A0 au fichier B/B0

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