Discussion :

[RTK45]

Bonjour à tous,

je dois installer un logiciel en local sur ma machine au travail, étant habitué à posséder des droits d'administrateur sur ma machine personelle je n'ai pas l'habitude de devoir procéder à une installation "manuelle".

Un document expliquant la marche à suivre est fournie, mais étant peu familiarisé avec les variables d'environnement, je n'arrive pas à appliquer la procédure.

Peut être pourrez vous m'aider, voici la marche à suivre:

To run DIALIGN 2.2 on your system:

Create an environment variable DIALIGN2_DIR pointing to the directory

your_path/dialign2_dir

where `your_path' is the directory where you just unpacked the DIALIGN 2
package

( setenv DIALIGN2_DIR /your_path/dialign2_dir/ )

To run properly, the program needs the following four files:

tp400_dna, tp400_prot, tp400_trans, BLOSUM

These files are contained in the directory `dialign2_dir'. You may move
them, of course, to any other directory and set DIALIGN2_DIR accordingly.

Add the DIALIGN 2 directory (/your_path/dialign2_dir/) to the environment
variable PATH, so that the program can be called from every other directory.

( setenv PATH $PATH":/your_path/dialign2_dir" )

To keep these environment variables for your next sessions also, put the
commands into your .cshrc file (or .tcshrc ... depending on your shell).

Je précise que j'ai décompréssé l'archive sur mon Bureau, j'ai donc obtenu un fichier

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

dialign2_dir

Je me suis renseigné sur ce qu'était les variables d'environnement sur internet, mais malgrès ça je n'arrive pas à en définir une qui pointrait sur mon dossier. Si j'ai bien compris je dois définir une variable qui part du dossier contenant l'archive (donc Bureau) et qui pointe sur le dossier décompréssé (c'est à dire dialign2_dir).

J'ai également essayé d'executer cette commande

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

setenv DIALIGN2_DIR /Bureau/dialign2_dir/

depuis le shell, mais la commande setenv n'est pas reconnue.


Merci à vous

[Mandraxx]

Bonjour,

Si tu es sous Linux, il y a de fortes chances que tu sois sous bash par défaut... Tu peux le vérifier en faisant :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

echo $0

Qui devrait te renvoyer :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

-bash

Si c'est bien ça, il faut faire :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

export DIALIGN2_DIR=${HOME}/Bureau/dialign2_dir

export permet de créer une variable qui sera partagée avec les sous-processus de ton shell.
DIALIGN2_DIR est le nom de la variable d'environnement ainsi créée.
Comme ton bureau doit-être dans ton dossier personnel qui est lui même pointé par la variable d'environnement HOME, il ne faut pas mettre /Bureau/dialign2_dir comme valeur (car ça m'étonnerait que ton bureau soit dans la racine du système de fichier) mais il faut préfixer cette valeur par ${HOME} pour obtenir un chemin absolu valide

Pour aller plus loin, je te conseille cet excellent tutoriel sur la maîtrise de bash : http://eric-sanchis.developpez.com/linux/shell/bash/

@+

[RTK45]

Merci beaucoup pour votre aide et vos explications

Je vais étuider ce tutoriel de près.

Bonne journée