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Statnet, Gplot : colorer les nœuds ?


Sujet :

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  1. #1
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    Par défaut Statnet, Gplot : colorer les nœuds ?
    Bonjour,

    Mon problème est simple et, pourtant, n'ai pas réussi à trouver de réponse dans les manuels ou sur internet.
    Je cherche à réaliser un graph de réseau à l'aide du module statnet et de la fonction gplot. J'y importe un tableau à deux colonnes : les données de la colonne 1 sont mis en rapport avec ceux de la 2.
    Pour plus de lisibilité, j'aimerai colorer différemment les nœuds (vertex) du graphique, selon qu'ils appartiennent à la première ou à la seconde colonne.

    J'ai pu trouver des explications sur les manières de modifier les arêtes en fonction d'un vecteur de valeurs, mais ne comprend pas comment faire pour les nœuds ! Merci d'avance pour les pistes que vous pourriez m'indiquer car, là, je sèche.

  2. #2
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    Bonsoir,

    je découvre ce package et je ne suis pas sûre de comprendre ce dont on parle
    J'ai trouvé une information dans cet article:
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2443947/ :
    There are four different vertex attributes associated with the vertices in this network: “vertex.names”, “Race”, “Sex”, and “Grade.” Grade is likely to be a strong determinant of social relations, so let us visualize the network with vertices colored by their grade:

    R> plot(fmh, displayisolates = FALSE, vertex.col = “Grade”, vertex.cex = 0.7)
    Est-ce que les noms des colonnes correspondent à un des 4 vertex?

    Bonne soirée

    PS: en plus, il ne s'agit pas de gplot, je dois donc avoir tout faux
    Je laisse néanmoins le message au cas où cet article vous aurait échappé

  3. #3
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    Bonjour,

    Merci pour cet article, que j'avais consulté mais que, pour le coup, j'ai examiné à nouveau.
    En suivant les instructions qu'ils y indiquent j'ai noté que la différence entre leur exemple (p. 3-4) et mon cas est celui ci :
    le réseau qu'ils utilisent à 4 «vertex attributes» contenant des données chiffrées.
    Dans mon cas summary() donne :

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    1
    2
    3
    4
    Vertex attributes:
      vertex.names:
       character valued attribute
       324 valid vertex names
    Donc il ne semble pas que les colonnes correspondent à des «vertex attributes», une fois mon .csv transformé en network. Comment faire pour que ce soit le cas ?

  4. #4
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    Bonjour,

    je suis désolée, cela dépasse largement ma compréhension...
    Est-ce qu'ici, il n'y aurait pas une indication sur la façon de charger les données?

    Bon courage

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