Discussion :

[songavril]

Bonjour,

Tout d'abord j'explique un peu le contexte avant de vous poser ma question, le but de mon travail est de généré automatiquement un document LaTeX contenant des résultats R. Je dois en généré environ 400, c'est pourquoi on me demande d'automatiser le procédé!

Pour cela, j'ai fait mon fichier de code.Rnw contenant donc du LaTeX et du R
et pour l'exécuter je dois utiliser dans R la commande Sweave sur ce fichier.

Quand je le fais pour un seul fichier, ça marche très bien!
Cependant dès que j'essaye de faire ma boucle, problème, le fichier .Tex produit par l'utilisation de la commande Sweave est écrasé à chaque fois par le nouveau tour de boucle.

Voici ce que j'ai fait :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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for(id in id_table$ID)
{
  Sweave("code.Rnw")
}

en fait, ce que je voudrais faire c'est insérer l'ID dans le nom du fichier produit par le Sweave, ainsi son nom changerait à chaque tour de boucle et il ne serait pas écrasé.

Merci d'avance et désolée mais je suis vraiment débutante dans l'utilisation de Sweave...

[dev_ggy]

Avec la commande system tu peux passer des commande shell au dos et donc déplacer ou renommer les fichiers que tu souhaites dans ta boucle.

Bien à toi,

[pitipoisson]

Bonjour,

Il suffit de préciser le nom du fichier de sortie :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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for(id in id_table$ID)
{
  Sweave("code.Rnw", output=paste("code-", id, ".tex", sep=""))
}

[songavril]

Merci beaucoup! c'est tout à fait ça, je ne connaissais pas cette option de Sweave!