Discussion :

[emmachane]

Bonjour,

J'ai deux fichiers. Le premier est un fichier de paramétrage et le second, un fichier de données.

fichier paramétrage ressemble à :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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chaine01;chaine02;chaine03;chaine04
chaine05;chaine06;chaine07;chaine08
chaine09;chaine10;chaine11;chaine12

Je lis le fichier de paramétrage. Pour chaque ligne de ce fichier (colonne1, colonne2 et colonne4), je souhaite rechercher celles-ci dans le fichier de données.

le fichier de données ressemble à :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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chaine01   chaine02      toto      chaine04.....
chaine05   chaine06      tata      chaine08.....
chaine12   chaine10      tata      chaine12......

La condition est la présence (& logique) des colonnes 1, 2 et 4 dans le fichier de données. Si l'une de des colonnes n'est pas présente dans le fichier de données, je ne prends pas l'enregistrement.

In fine, par rapport à cet exemple, dans mon fichier résultat, j'aurais

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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chaine01     chaine02       toto      chaine04.....
chaine05     chaine06       tata      chaine08.....

Quant à l’enregistrement

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

chaine12   chaine10      titi        chaine12......

Il ira à la poubelle car la première colonne du fichier param parle de "chaine09"

La commande grep peut-elle répondre à ce besoin ?

[paissad]

Bonjour,
dis en un peu plus sur les chaînes de caractères (leur composition possible)
Est ce que ces chaînes (chaine1, chaine2 ....) peuvent contenir des espaces ?
Quel est le caractère d'espacement de tes colonnes dans le fichier de données (un espace ? une tabulation ? ...)

[lennelei]

Tu peux utiliser IFS par exemple.

Version basique :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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$ cat filtre.txt
chaine01;chaine02;chaine03;chaine04
chaine05;chaine06;chaine07;chaine08
chaine09;chaine10;chaine11;chaine12
$ cat data.txt
chaine01   chaine02      toto      chaine04 ....
chaine05   chaine06      tata      chaine08 ....
chaine12   chaine10      tata      chaine12 .....
$ cat grep.bash
#!/bin/bash
 
while IFS=';' read colonne1 colonne2 colonne3 colonne4
do
        grep $colonne1 data.txt | grep $colonne2 | grep $colonne4
done < filtre.txt
$ bash grep.bash
chaine01   chaine02      toto      chaine04.....
chaine05   chaine06      tata      chaine08.....

Mais il va sans dire que le grep est assez léger dans ce cas puisqu'il ne se base pas vraiment sur une "colonne".

Tu peux utiliser awk mais la version simple demande à ce que tu sois certain que telle colonne du filtre corresponde à telle colonne des donnés :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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$ cat grep.bash
#!/bin/bash

while IFS=';' read colonne1 colonne2 colonne3 colonne4
do
        awk '$1 =="'$colonne1'" && $2 == "'$colonne2'" && $4 == "'$colonne4'" {print}' data.txt
done < filtre.txt
$ bash grep.bash
chaine01   chaine02      toto      chaine04 ....
chaine05   chaine06      tata      chaine08 ....

Après, tu peux compliqué le traitement awk pour vérifier tous les champs contre toutes les valeurs du filtre à l'aide d'un if par exemple...

[emmachane]

Est ce que ces chaînes (chaine1, chaine2 ....) peuvent contenir des espaces ?

Non, chaine1,2 c'est en un seul mot.


Quel est le caractère d'espacement de tes colonnes dans le fichier de données (un espace ? une tabulation ? ...)

La 1ère colonne démarre de 1 -> 25
La 2ème colonne démarre de 26 -> 54
La 4ème colonne démarre de 115 -> 151

[lennelei]

Qu'est-ce qu'il doit se passer si tu as ceci :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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chaine01   chaine02      toto      chaine04.....
chaine0105 chaine02      tata      chaine04.....
chaine12   chaine10      tata      chaine12......

?

[emmachane]

Qu'est-ce qu'il doit se passer si tu as ceci :
La correspondance doit être exacte. Ce qui revient à dire que la ligne

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

chaine0105 chaine02      tata      chaine04.....

ne doit pas être prise car, la première colonne n'est pas chaine01 mais chaine0105

[becket]

En considérant qu'il est possible d'avoir plusieurs occurrences valide et avec AWK :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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DesHaches:~# cat data.txt
chaine01   chaine02      toto      chaine04
chaine05   chaine06      tata      chaine08
chaine12   chaine10      tata      chaine12

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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DesHaches:~# cat recherche.txt
chaine01;chaine02;chaine03;chaine04
chaine05;chaine06;chaine07;chaine08
chaine09;chaine10;chaine11;chaine12

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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DesHaches:~# cat chaine.awk
{
  RESULT=1
  while( RESULT == 1 )
     {
         RESULT=getline LIGNEDATA < "recherche.txt"
         split(LIGNEDATA,TABRESULT,";") ;
         if ( TABRESULT[1] == $1  &&  TABRESULT[2] == $2  &&  TABRESULT[4] == $4 )
          {
              print $0
           }
 
     }
close("recherche.txt")
}

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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DesHaches:~# awk -f chaine.awk  data.txt
chaine01   chaine02      toto      chaine04
chaine05   chaine06      tata      chaine08