Discussion :

[Thomas77380]

Bonjour à tous,

je me demandais s'il existait une méthode équivalente a SubString en python, cette méthode prend en argument une position de début et une position de fin et renvoie la chaîne de caractère située entre les 2 positions. J'ai fais des recherches sur internet, sans résultat.

Je parcours un fichier contenant des couples de positions (correspondant a des fragments de séquence) et une méthode telle que celle la me faciliterait les choses

[josmiley]

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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>> "azertyuiop"[4:8]
tyui

[Thomas77380]

En fait je me suis mal exprimé ce que ne j'arrive pas à faire c'est récupérer les positions de début et de fin en parcourant mon fichier, les données se présentent sous cette forme :

428 508 + [-28.9] (((.(((.(((((............((((((.(.......(((........)))....).))))))..))))).))).)))
639 695 + [-24] ((((.(((.((((((((((.......))))))))))...........)))...))))
642 681 + [-25.7] ((((((((((((((((.......)))))))))).))))))

et je voudrais récupérer les positions de début (bleu) et de fin (rouge) afin de pouvoir récupérer les morceaux de séquences correspondants en faisant des:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

print seq[debut:fin]

j'ai commencé par vouloir passé outre les regex mais sans succès, j'étudie les tutorials disponibles sur internet mais je n'arrive pas à construire quelque chose de viable, je pensais récupérer ma première suite de nombre (en bleu) avec un [0-9+] jusqu'a ce qu'on rencontre un espace, puis idem pour la position de fin.

[valAa]

Salut, si j'ai bien compris,
La méthode de chaîne split() découpe une chaîne sur une suite de caractères donnés (par defaut espace).
Donc par exemple,

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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Python 2.6.5 (r265:79063, Apr 16 2010, 13:09:56) 
[GCC 4.4.3] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> seq = "428 508 + [-28.9] (((.(((.(((((............((((((.(.......(((........)))....).))))))..))))).))).)))"
>>> debut, fin = seq.split()[0:2]
>>> int(debut)
428
>>> int(fin)
508