Discussion :

[alaninho]

Bonjour,

J'aimerai savoir comment on peut remplacer des chemins absolus par des chemin relatifs.

Par exemple ;

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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def showDialog_msa1(self):
        self.filename_msa1 = QFileDialog.getOpenFileName(self, 'Open file', '/home/lahure/Documents')
        fname = open(self.filename_msa1)
        self.data_file_msa1 = fname.read()
        self.namefile_msa1.setText(self.filename_msa1)

ou ici ;

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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def treatment(self):
        self.parserfile()
        tabID=[]
        tabseq=[]
        tablength=[]
        sequence=""
        i=0
        fich=open("/home/lahure/Documents/msadiff/files/"+self.file_read,"r")
        for line in fich:
            line=line.replace("\n","")
            line=line.replace(".","-")
            if re.match("^>",line):
                id_len=line.split("/")
                tabID.append(id_len[0])
                tablength.append(id_len[1])
                tabseq.append(sequence)
                sequence=""
            else:
                sequence=sequence+line
                sequence=sequence.upper()
        tabseq.append(sequence)
        tabseq.remove("")
        length=len(tabseq)
        self.set_seq_object(tabID, tablength, tabseq, length)

J'aimerai ne plus avoir de chemin absolu, mais je sais pas du tout comment faire.

Alaninho

[Golgotha]

Bonjour,

Tu peux peut être utiliser la commande :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

os.getcwd()

qui te permet d'avoir le chemin du fichier .py que tu exécute, à partir de ce chemin, à toi de compléter l'adresse.

Ou, de mettre "/home/lahure/Documents" en variable de configuration, comme ça si ça change tu ne le change qu'une seule fois dans ton programme.

[alaninho]

Je peux pas utiliser /home/lahure/documents car ensuite le programme sera sur un serveur et donc l'accès à mon compte sera privé.
Tu peux me donner un exemple avec la commande os.getcwd() stp.

Merci

[rambc]

Bonjour.

os.getcwd() va renvoyer le dossier d'où est lancé le script, et non où est le script.

Personnellement, j'utilise : os.path.dirname( __file__ ).

[alaninho]

Merci, pourrai-je avoir un exemple avec os.getcwd(), car je comprend par en quoi elle remplace le chemin absolu.

[mont29]

alaniho, l’idée est bien de mettre “en dur” dans ton code un chemin relatif vers ton/tes fichiers ?

Dans ce cas, il faut que tu récupères la racine courante de ce chemin relatif.

os.getcwd() va te retourner le chemin absolu vers le dossier d’où a été lancé ton script (le dossier courant dans la console dans laquelle tu l’as lancé, par ex.)

os.path.dirname(__file__) va te retourner le chemin absolu vers le dossiercontenant ton script (file étant une variable spéciale qui contient toujours le chemin absolu vers le fichier du script).

À toi de voir quelle option (quelle racine) te conviendrait le mieux.

Ensuite, une fois que tu as ta racine, tu la joint à ton chemin relatif pour obtenir le chemin définitif.

Par exemple, en supposant que tes fichiers soient dans un dossier data, frère du dossier contenant ton script, tu fais :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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import os
root = os.path.dirname(__file__)
rel_path = os.path.join("..", "data")
 
abs_path = os.path.join(root, rel_path)
 
# Tu peux maintenant utiliser abs_path…

PS : Utilise toujours os.path.join pour assembler les éléments de test chemins, comme ça python se charge de gérer les différents séparateurs selon l’OS courant (/ sous Unix, \ sous Windows, etc.).

[kango]

bonjour,

avec os.path.relpath