Discussion :

[jane40]

Bonjour,

Je fais des calculs dans une fonction. Elle renvoit 2 sorties, abscisse et ordonnee, que je vais utiliser pour un graphique. J'utilise sapply sur cette fonction.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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calcul_mean_median=function(donnees_exp1,k,res){
moy=mean(as.numeric(donnees_exp1[k,]))
mediane=median(as.numeric(donnees_exp1[k,]))
abscisse=min(moy,mediane)/max(moy,mediane)
ordonnee=max(res$resVarA[k],res$resVarB[k])
return(list(abscisse=abscisse,ordonnee=ordonnee))
}
 
s_mean_median=sapply(i, function(k) {calcul_mean_median(donnees_exp1,k,res)})

Mon problème est que je n'arrive plus à accéder à mes 2 champs en sorties. Mais je sais y accéder si je n'applique pas de sapply :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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> s_mean_median$
+ abscisse
NULL
> s_mean_median$
s_mean_median$
 
calcul_mean_median(donnees_exp1,1,res)
$abscisse
[1] 0.9496997
 
$ordonnee
[1] 0.1073555

Comment faire pour régler ce problème ?
Merci

[A. D.]

Bonjour,


Tout d'abord, si vous en avez la possibilité, il est toujours sympa d'ajouter un extrait de vos données (court mais représentatif) qui nous permette de faire tourner vos fonctions, cela fait gagner du temps à tout le monde.


Deuxièmement, je ne comprends pas ce que représente le " i " lorsque vous écrivez :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

s_mean_median=sapply(i, function(k) {calcul_mean_median(donnees_exp1,k,res)})

De plus, il me semble qu'il y a d'autres petites erreurs dans le code que vous mettez en deuxième partie.


Sinon, je pense que le "problème" vient en fait de l'utilisation de la fonction "sapply".
En effet, cette fonction renvoie en sortie un vecteur ou une matrice, donc dans votre cas, si par exemple vous l'appliquer pour k=1:2, vous obtiendrez en sortie une matrice de cette forme :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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> s_mean_median
         [,1]    [,2]     
abscisse 1.48347 0.7812197
ordonnee 2       2

D'où le fait que vous ne puissiez pas accéder à "s_mean_median$abscisse" par exemple.

Si vous souhaitez obtenir en sortie une liste, il est préférable d'avoir recours à la fonction "lapply".
Vous obtiendrez alors une sortie de la forme suivante :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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> s_mean_median
[[1]]
[[1]]$abscisse
[1] 1.48347
 
[[1]]$ordonnee
[1] 2
 
 
[[2]]
[[2]]$abscisse
[1] 0.7812197
 
[[2]]$ordonnee
[1] 2

Ensuite, pour accéder par exemple à l'élément "abscisse" pour le cas k=1, appeler :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

s_mean_median[[1]]$abscisse

En espérant que ceci réponde à votre question, bonne continuation


Cordialement,

A.D.

[jane40]

Bonjour,


Tout d'abord, si vous en avez la possibilité, il est toujours sympa d'ajouter un extrait de vos données (court mais représentatif) qui nous permette de faire tourner vos fonctions, cela fait gagner du temps à tout le monde.

Ok pour la prochaine fois

Deuxièmement, je ne comprends pas ce que représente le " i " lorsque vous écrivez :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

s_mean_median=sapply(i, function(k) {calcul_mean_median(donnees_exp1,k,res)})

le i, c'est le k, qui varie effectivement de 1 à n...

De plus, il me semble qu'il y a d'autres petites erreurs dans le code que vous mettez en deuxième partie.


Sinon, je pense que le "problème" vient en fait de l'utilisation de la fonction "sapply".
En effet, cette fonction renvoie en sortie un vecteur ou une matrice, donc dans votre cas, si par exemple vous l'appliquer pour k=1:2, vous obtiendrez en sortie une matrice de cette forme :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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> s_mean_median
         [,1]    [,2]     
abscisse 1.48347 0.7812197
ordonnee 2       2

D'où le fait que vous ne puissiez pas accéder à "s_mean_median$abscisse" par exemple.

Si vous souhaitez obtenir en sortie une liste, il est préférable d'avoir recours à la fonction "lapply".

Effectivement, j'ai simplement changé sapply en lapply et je peux accéder à mes différents champs. Merci !

[jane40]

J'arrive à accéder à un des éléments de la liste :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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s_mean_median[[1]]$abscisse
[1] 0.9496997

Mais je n'arrive pas à accéder à l'ensemble des valeurs contenues dans un des champs. Je ne suis pas trop habituée à travailler avec les listes, j'ai essayé :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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s_mean_median[[1:2]]$abscisse
Erreur dans s_mean_median[[1:2]]$abscisse : 
  $ operator is invalid for atomic vectors
> s_mean_median[[]]$abscisse
Erreur dans s_mean_median[[]] : type 'symbol' d'indice incorrect
> s_mean_median$abscisse
NULL

Je souhaite récupérer toutes les valeurs de chaque champ pour les tracer sur un graphe. Peut-être que la liste n'est pas la plus adaptée alors...

[A. D.]

Re,

Je souhaite récupérer toutes les valeurs de chaque champ pour les tracer sur un graphe. Peut-être que la liste n'est pas la plus adaptée alors...

Je ne maîtrise pas parfaitement les listes, mais en effet, dans votre cas, si l'objectif final est de tracer un graphe avec les valeurs obtenues pour "abscisse" et "ordonnee", pourquoi ne pas utiliser la fonction "sapply"?
Ensuite il sera possible de récupérer les abscisses en prenant :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

s_mean_median[1,]

, et les ordonnées en prenant :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

s_mean_median[2,]

Bonne continuation


Cordialement,

A.D.

[jane40]

Alors j'ai rechangé lapply en sapply et effectivement, j'ai accès à mes données via une matrice. Le seul "problème" qu'il reste est que les valeurs de cette matrice ne sont pas numériques (peut-être dû à la présence de NA), et c'est un peu pénible de forcer la conversion à chaque fois. Je vais commencer par enlever tous les NA...

[A. D.]

Bonjour,

Effectivement, j'ai simplement changé sapply en lapply et je peux accéder à mes différents champs. Merci !

De rien


Juste comme ça :

le i, c'est le k, qui varie effectivement de 1 à n...

Dans ce cas, écrire :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

s_mean_median=sapply(1:n, function(k) {calcul_mean_median(donnees_exp1,k,res)})

Bonne continuation


Cordialement,

A.D.