Module Bio::Tools::Run::Alignment::Clustalw


J'aimerais que dans le fichier de sortie, les séquences soient regroupées selon la similarité :

Documentation de ClustalW : output format options
OUTPUT ORDER
You can decide in which order you want the sequences in the alignment appear. The options are:
1. ALIGNED: depending on the punctuation in the alignment: from more to less far away.
2. INPUT: the order is the same used by the user to introduce the sequences.
J'ajoute donc dans @params : -outputorder = ‘aligned’ mais cela ne change rien


avez-vous une idée du pourquoi?


merci