Bonjour,
Je ne sais pas si je suis sur le bon forum et, dans le cas contraire, je m'en excuse.
Voilà, j'ai un jeu de séquences préalignées et je cherche à connaitre leur score d'identité 2 à 2.
Lorsque j'utilise Bioedit (avec la fonction matrice d'identité), les résultats que j'obtiens sont des scores d'identités globaux et non locaux. Je m'explique; si l'on prend 2 séquences, une de 1000 bases et une plus petite de 800 bases, identiques sur 800 bases, le score d'identité que l'on obtient est de 80% et non de 100%. Y a-t-il une possibilité par BioEdit ou autre d'obtenir le score sur la zone d'alignement uniquement ? Merci par avance.
Bien cordialement,
poumy.
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