Discussion :

[manoir]

Bonjour a tous,
Je souhaiterais trier un data frame selon le facteur Gene, ex

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
Gene      vol traitement
1     7A5 31.32608        tem
2    A1BG 34.64883        tem
3    A1BG 31.57093        tem
4    A1CF 30.85881        tem
5    A1CF 32.08234        tem
6    A1CF 31.32178        tem
7   A26A1 30.55938        tem
8   A26A1 31.28246        tem
9   A26B1 31.69054        tem
10 A26C1B 31.33579        tem

donc j'aimerais avoir la sortie suivante

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
6
 Gene      vol traitement
1      7A5 31.32608        tem
48804  7A5 31.30720      early
97607  7A5 31.53254       late
----------------------------
----------------------------

Merci par avance

Manoir

[pitipoisson]

Bonjour,

Il faut utiliser la fonction order()

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

datao <- data[order(data$Gene), ]

[manoir]

Bonjour,
Merci pour ta réponse, en fait j'ai déjà essayer order mais, j'obtiens une sortie anormale

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
          Gene      vol traitement
           1-Dec 30.82848        tem
55922  1-Dec 31.23745      early
104725 1-Dec 30.35483       late
34689  1-Mar 32.36397        tem
34690  1-Mar 31.65209        tem
83492  1-Mar 32.90736      early
83493  1-Mar 30.39219      early
132295 1-Mar 33.71496       late
132296 1-Mar 32.13100       late
42284  1-Sep 60.89631        tem

les niveaux du facteur gène ont changé ??

Merci

[pitipoisson]

les niveaux du facteur gène ont changé ??

Ça m'étonnerait beaucoup. Je penche plutôt pour un problème à l'import des données que tu n'as pas remarqué jusqu'au moment du tri.

[manoir]

ça y est j'ai trouvé le bug, t'as tout à fait raison c'est un problème d'importation de fichier: lors de l'importation le levels de mon facteur Gene ne correspond pas aux noms de mes genes!!! du coup j'ai lancé cette ligne de code:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

levels(Gene)<-as.character(unique(Gene))

et ça fonctionne !

Merci pitipoisson