Discussion :

[FunkyDidi]

Bonjour,

J'essaye, depuis hier, de modifier l'affichage dans une certaine figure afin que l'utilisateur puisse non seulement choisir un pixel sur ladite image mais qu'il ait en même temps accès à la valeur du pixel correspondant.
J'utilise pour le moment des figures pour l'affichage de l'image. Je ne peux pas me contenter d'utiliser imtool pour l'affichage de la valeur du pixel car je dois d'abord faire un calcul sur cette valeur.

Pour le moment, les datacursor c'est pas trop mon truc mais j'ai tenté quelques petites choses :

voila le script pour le test que je suis en train de réaliser.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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close all;
clear all;
 
I = imread('cameraman.tif');
figure(); imshow(I);
 
dcm_obj = datacursormode(gcf);
set(dcm_obj,'UpdateFcn',@mafonction,...
    'DisplayStyle','window',...
    'Enable','on');
 
uiwait;
 
p = ginput(1);
display(p);

uiwait n'est là que pour voir si l'affichage de la position des pixels fonctionne correctement. Ce qu'on remarque : la fenêtre affiche les positions du pixel choisit quand l'utilisateur clique sur ce pixel ! or j'aurai besoin que l'affichage se fasse dès que la souris passe sur l'image sans que l'utilisateur ne clique sur l'image...
Sans uiwait : on ne voit rien le programme passe à ginput.

Je change la propriété 'UpdateFcn' avec la fonction suivante :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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function [ output_txt ] = mafonction(~, event_obj)
%UNTITLED4 Summary of this function goes here
%   Detailed explanation goes here
 
pos = get(event_obj,'Position');
 
num2str(pos(1:2),'(%d,%d)')
 
output_txt = {['X: ',num2str(pos(1),4)],...
    ['Y: ',num2str(pos(2),4)]};
 
end

Quelques difficultés donc pour combiner datacursormode qui permet à l'utilisateur de vérifier le pixel en question et ginput pour sélectionner ce pixel... l'étape suivante sera donc de récupérer la valeur du pixel sur l'image correspondante....

Toute aide sera appréciée ^^
Merci !

[FunkyDidi]

Un petit up pour ce topic et tant qu'à faire autant commencer par plus simple.

Le fait est que l'image traitée est une image DICOM donc je dois convertir l'intensité en HU selon la formule suivante :
HU = intensité*RescaleSlope + RescaleIntercept;
Les variables RescaleSlope et RescaleIntercept sont obtenus après utilisation de la fonction dicominfo sur le fichier DICOM.

Je voudrais alors afficher cette info à l'aide du datacursor mode lorsque j'appuie sur un bouton.

Voici le code du bouton en question (essai non concluant...)

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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function pushbutton11_Callback(hObject, eventdata, handles)
% hObject    handle to pushbutton11 (see GCBO)
% eventdata  reserved - to be defined in a future version of MATLAB
% handles    structure with handles and user data (see GUIDATA)
 
Image = handles.dataStruct.('original'); 
%check if dicom file has been opened
 
if ~ischar(Image) %Dicom file has been opened --> let's do this !
    %close all but main GUI
    set(handles.figure1,'HandleVisibility','off');
    close all;
    set(handles.figure1,'HandleVisibility','on');
 
    display_HU = figure('name','DICOM Image'); imshow(Image,[]);
    dcm_obj = datacursormode(gcf);
    set(dcm_obj,'UpdateFcn',@mafonction,'DisplayStyle','window','Enable','on');
end

et donc, ca va avec, ma tentative avec la fonction mafonction

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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function [ output_txt ] = mafonction(~, event_obj)
%UNTITLED4 Summary of this function goes here
%   Detailed explanation goes here

pos = get(event_obj,'Position');

num2str(pos(1:2),'(%d,%d)')
Image = handles.dataStruct.('original');
HU = Image(pos(1), pos(2))*handles.dicominfo.RescaleSlope + handles.dicominfo.RescaleIntercept;
disp(handles.dicominfo) %simple test

output_txt = {['X: ',num2str(pos(1),4)],...
    ['Y: ',num2str(pos(2),4)],...
    ['HU: ',num2str(HU)]};

end

Si je relance ce poste c'est que... ça ne marche pas !
Mais il n'y a tout de même pas d'erreur dans la Command Window !
par contre mes tests semblent indiquer que ces trois lignes ne fonctionnent pas :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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Image = handles.dataStruct.('original');
HU = Image(pos(1), pos(2))*handles.dicominfo.RescaleSlope + handles.dicominfo.RescaleIntercept;
disp(handles.dicominfo) %simple test

et au niveau de la petite fenêtre dont j'aurais souhaité qu'elle affiche les coordonnées du point et la valeur HU, tout ce qui est écrit est :

Error in custom
datatip string function

une petite idée ?

merci d'avance !

[Jerome Briot]

Jette un œil ici : obtenir coordoonnees de la souris dans une image