Discussion :

[kryss01s]

Bonjour, je souhaite réaliser une macro qui analyse le nombre de particules, puis supprime certaines dont la taille serait trop petites.

J'arrive à faire l'analyse de particule, mais pour supprimer les particules qui ne m'interesse pas sur l'image je ne sais pas comment faire!

le but serait de calculer une aire sans les particules trop petites puis , superposer l'image originale avec l'image binaire pour visualiser les zones qui ont été pris en compte.

[ToTo13]

Je ne connais pas du tout les macros ImageJ :-(
Mais si tu t'y connais un peu en Java, tu peux facilement faire une classe qui fait ce que tu souhaites.
J'ai posté du code source Java qui étiquette les composantes et calcule leur taille. Il y a peut être même la suppression des trop petites/grandes.

[kryss01s]

Je m'y connais pas en Java, mais vu les problèmes que je rencontre je vais m y plonger.
Aurais tu des documents à conseiller?

Sinon j'ai trouvé un plugin "particules analysis" qui est finalement pas mal.
Mais je vais quand même jeter un oeil sur ton code source.

Merci!

[ToTo13]

Aurais tu des documents à conseiller?

Java étant le langage le plus utilisé, il y a tout ce qu'il faut sur le web pour démarrer, à commencer par tout les tutos svp.
Pour l'étiquetage des composantes connexes, tu peux regarder l'algorithme Union-Find.

[Kangourou]

salut,

pour supprimer les petites particules, un outil assez pratique est l'ouverture morphologique. On trouve des ref assez facilement, ainsi que des plugins de morphologie mathématique pour ImageJ.

Une version un peu plus propre est l'ouverture par reconstruction, qui consiste à ajouter une étape de reconstruction géodésique pour retrouver la forme originelle des objets. Là aussi, c'est dans les bonnes boîtes à outils de morpho math !

A+

[ToTo13]

pour supprimer les petites particules, un outil assez pratique est l'ouverture morphologique. On trouve des ref assez facilement, ainsi que des plugins de morphologie mathématique pour ImageJ.

Une version un peu plus propre est l'ouverture par reconstruction, qui consiste à ajouter une étape de reconstruction géodésique pour retrouver la forme originelle des objets. Là aussi, c'est dans les bonnes boîtes à outils de morpho math !

Dans son cas on parlerait d' "Area Opening", qui revient à faire ce que je propose.