Garder en mémoire un dictionnaire

**tom77380** · 17/12/2011, 15h30

Bonjour à tous,

Je dispose d'un fichier excel avec deux colonnes, je le lis, puis je crée un dictionnaire qui contient en clé les valeurs de la première colonne, et en valeurs les "valeurs" de la seconde colonne.

Mon but est d'assimiler les clés de ce dictionnaire à une colonne de données présente dans un autre fichier (ces données correspondent aux valeurs de mon dictionnaire).
Seulement lorsque je lis mon autre fichier et que je fais ma boucle, je perds les données de mon dictionnaire et la comparaison n'a pas lieu, je ne sais pas si je suis très clair

le code sera peu être plus parlant :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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File = open("mart_export-1.txt","r")    # r indique lecture
 
File2 = open("BIOGRID-ORGANISM-Homo_sapiens-3.1.81.tab2.txt","r")    # r indique lecture
 
 
 
dico={}
 
 
 
for ligne in File.readlines():
 
	ligne = ligne.rstrip('\n') # on retire le dernier caractere (retour chariot)
	cols = ligne.split(',')    # Decoupage de la ligne pour recuperer les differents elements
 
 
	if dico.has_key(cols[0])==False: #si la valeur lue n'est pas une cle du dico, alors on l'ajoute
		dico[cols[0]]= cols[3]   # on attribut a cette cle la valeur situee dans la colonne 3 (IDENTREZ)
	else:
		pass
 
 
 
 
	for ligne2 in File2.readlines():
		ligne2 = ligne2.rstrip('\n') # on retire le dernier caractere (retour chariot)
		cols2 = ligne2.split('	')    # Decoupage de la ligne pour recuperer les differents elements
		if dico.values() == cols2[1]:   # si la valeur de la colonne correspond a la valeur de mon dico : ok
			print "ok"

Je n'ai pas de soucis de compilation, mais le dico que j'utilise dans ma seconde boucle est "vidé" de ses valeurs, ma comparaison ne me renvoie donc aucun "ok". Je voudrais donc savoir comment réutiliser mon dico dans le nouveau fichier de lecture.

J'espère avoir été clair je m'y perds moi même parfois

Merci à vous

**PauseKawa** · 17/12/2011, 15h47

Bonjour,

Vous rendez vous compte que votre première boucle n'est pas finie ?

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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for ...
    premier traitement
    for ....
        on ne travaille que sur le premier résultat.

Ce n'est pas plutot:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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for ...
    traitement
for ....
    traitement.

@+

**afranck64** · 17/12/2011, 15h48

Je pense que tout à été dit. +2**0 PauseKawa

**tom77380** · 17/12/2011, 15h51

En effet vous avez raison mon indentation était incorecte, seulement je n'ai toujours pas de retour sur la comparaison (alors que je suis sur que des valeurs sont bien équivalentes), cette ligne là est'elle corecte ?

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

if dico.values() == cols2[1]:

Je compare bien la valeur de mon dico aux valeurs de la colonne de mon fichier de lecture ?

**afranck64** · 17/12/2011, 15h57

Envoyé par tom77380

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

if dico.values() == cols2[1]:

Je compare bien la valeur de mon dico aux valeurs de la colonne de mon fichier de lecture ?

Euh, je me questionne à ce niveau.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

dico[cols[0]]= cols[3]   # on attribut a cette cle la valeur situee dans la colonne 3 (IDENTREZ)

Pourriez vous nous présenter une sortie à coup de "print" de cols?

**tom77380** · 17/12/2011, 16h06

Bonjour,

Pourriez vous nous présenter une sortie à coup de "print" de cols?

désolé je ne suis pas sur d'avoir compris, voici ce que me renvoie les différents print de cols lorsque je suis dans ma première boucle
cols[0]

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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ENSG00000090975                       
ENSG00000090975
ENSG00000090989
ENSG00000090989
ENSG00000090989
ENSG00000090989
ENSG00000090989
ENSG00000090989
ENSG00000090989
ENSG00000090989
ENSG00000090989
ENSG00000090989
ENSG00000090989
ENSG00000091009
ENSG00000091009
ENSG00000091009
ENSG00000091010
ENSG00000091010
ENSG00000091010
ENSG00000091010
ENSG00000091010
ENSG00000091039
ENSG00000091039

cols[3]

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

j'ai également affiché mon dico pour voir qu'il avait été rempli correctement:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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2
 
ENSG00000165502': '6166', 'ENSG00000188779': '390598', 'ENSG00000160345': '138162', 'ENSG00000072832': '1400', 'ENSG00000128594': '64101', 'ENSG00000026751': '57823', 'ENSG00000128591': '2318', 'ENSG00000128590': '4189', 'ENSG00000184887': '90135', 'ENSG00000100744': '51527', 'ENSG00000129353': '57153', 'ENSG00000100211': '25776', 'ENSG00000033327': '9846', 'ENSG00000142173': '1292', 'ENSG00000100968': '4776', 'ENSG00000206395': '23564', 'ENSG00000100218': '27156', 'ENSG00000120235': '3443', 'ENSG00000100749': '7443', 'ENSG00000151623': '4306', 'ENSG00000196378': '80778', 'ENSG00000121579': '80218', 'ENSG00000181927': '81300', 'ENSG00000130830': '4354', 'ENSG00000107779': '657', 'ENSG00000125551': '5342', 'ENSG00000204983': '5644', 'ENSG00000143457': '55204', 'ENSG00000134256': '9398', 'ENSG00000134255': '10390', 'ENSG00000166348': '159195', 'ENSG00000134253': '80263', 'ENSG00000143452': '84072', 'ENSG00000134250': '4853', 'ENSG00000097033': '51100', 'ENSG00000134259': '4803', 'ENSG00000134258': '79679', 'ENSG00000185432': '25840', 'ENSG00000197153': '8350', 'ENSG00000124935': '10647', 'ENSG00000186187': '84937', 'ENSG00000124939': '4246'}

Biensûr il a des dizaines de millier de lignes en tout.

EDIT: et un extrait de cols2[1]

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

**PauseKawa** · 17/12/2011, 16h07

Envoyé par afranck64

Pourriez vous nous présenter une sortie à coup de "print" de cols?

Et là tout est dit: pensez à faire un print de vos valeurs, vous trouverez l'erreur.

@+ et bon code.

Note: if cols[0] not in dico

Edit: grilled

**tom77380** · 17/12/2011, 16h11

D'accord merci pour vos conseils je vais regarder tout ça

**PauseKawa** · 17/12/2011, 16h12

Ce n'est pas if cols2[1] in dico.values() ?

**tom77380** · 17/12/2011, 16h14

Ce n'est pas if cols2[1] in dico.values() ?

Merci à vous

, ma synthaxe était mauvaise. (je ne comprends pas comment était interprétée ma ligne puisque je n'avais pas de message d'erreurs).

**PauseKawa** · 17/12/2011, 16h18

J'adore l''aircoding'

Pensez à utiliser in lorsque c'est possible, c'est puissant

**afranck64** · 17/12/2011, 16h21

Au vu du "log" je pense avoir trouvé le soucis. Il me semble que les "clés" apparaissent plusieurs fois dans votre premier fichier.

a,bla,toto
b,bla,rah
a,bla,tata

Vous donne le dico:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

{'a':'toto','b':'rah'

En supposant votre second fichier soit "identique" au précédent, votre liste cols2 sera:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

cols2 = ['toto','rah','tata']

et puis la comparaison sera toujours fausse.

**PauseKawa** · 17/12/2011, 16h24

Envoyé par tom77380

je ne comprends pas comment était interprétée ma ligne puisque je n'avais pas de message d'erreurs

Et bien dico.values() vous retourne la liste (un objet dict_values en Python 3, ce n'est pas le cas ici) des valeurs de dico et vous le comparez à une valeur: donc ce n'est pas une erreur mais c'est False.