Recherche:

Je trouve pour ma part (avec le peu d'expérience que j'ai, hé oui je débute), que ce serait une très bonne idée ...

Finalement, il y a peu d'outils gratuits, simples d'installation, paramétrables...

Très bien !!

Effectivement, ça peut aider. Dans mon cas, je jongle avec des locus sur plusieurs chromosomes donc la DB c'est pour plus tard.

J'ajoute juste pour ceux que ça intéresse qu'on peut...

Non, je n'ai que les bornes et le chromosome ... Aucune séquence.
J'ai cherché ce genre de choses dans biomaRt, mais les requêtes sont du style de celle de l'interface sur le site ... donc ce n'est...

Merci,

J'avais déjà vu cette fonction, mais elle s'applique à un objet de type séquence, c'est à dire avec une séquence associée.

Ma question était comment peut-on récupérer simplement une...

En fait, j'avais besoin de sortir la séquence (pas les contigs, ni les transcrits à la suite) format fasta, pour, par exemple, le chromosome 2 entre la base numéro 45265498 et 78456123 (=start et...

Bonjour à tous,

Je m'excuse par avance si ma question a déjà été posée ou si la réponse est évidente.:roll:

Je cherche à récupérer une séquence complète (pour plusieurs organismes différents) à...

En ce qui concerne la date d'inscription, je ne sais pas. De mon temps (c'est à dire il y a 2 ans), il y avait pas mal de places disponibles, donc pas trop de stress de ce côté là. Mais évidemment,...

Ayant fait mon master BBSG à Luminy également, je plussoie tomaprice. Bonne ambiance, aucune difficulté pour y entrer et bonne formation.
Même si les langages de programmation sont un peu basiques...

Bonjour à tous,

J'utilise actuellement un script perl comprenant une requête biomart avec les modules
Biomart::Initializer;
BioMart::Query;
BioMart::QueryRunner;
BioMart::Registry;

La...