Recherche:

J'avais déjà rencontré ce problème du plugin 3D-drift (en fait il fonctionne que lorsque l'image est en 8-bit + frames au lieu de slices. Du coup ça y est la macro fonctionne !!! Vraiment trop...

J'ai remis un dossier dans le drive avec moins de datas qui doit etre plus rapide à charger que le précédent ! 8-)

C'est très clair et ça fonctionne très bien ! Merci :D:D !!

J'ai essayé d'ajouté quelques lignes qui corrigent le drift (comme dans mon ancienne macro) mais ça ne fonctionne pas :( :
...

Cette macro fonctionne très bien sur un stack, j'en ai testé plusieurs ! Merci !!


dir = getDirectory("Choose a Directory");
list = getFileList(dir);
for(i=0; i<lengthOf(list); i++)
{
if...

La pile d'images dont je parle est Aa-002 : https://drive.google.com/open?id=1Lu95Pza4qv63qQCBcEhVkaU7BfF_71X0

Merci pour le code !! Je l'ai testé sur une pile d'images qui justement à beaucoup de slices noires.
Dans un premier temps, j'ai pas vu d'amélioration (aucune ne s'était enlevée), donc j'ai modifié...

Et pour l'acquisition des images c'est le logiciel Prairie de chez Bruker que j'utilise.

Bonjour Cédric,

Pour ouvrir un stack, je fais :
file > import > image sequence
image > hyperstack > stack to hyperstack (paramètres : xyzct c=3 z=71 t=1)

voici le recorder :
run("Image...

Bonjour Cédric,

Merci beaucoup pour votre réponse !!
Voici un lien où on peut télécharger les stacks : https://drive.google.com/open?id=1Lu95Pza4qv63qQCBcEhVkaU7BfF_71X0

J'utilise pour...

Bonjour :D,

J'ai besoin d'aide pour écrire une macro servant à éliminer les slices noires dans un stack :

J’ai dans un dossier une série de stacks 1,2,3, etc (environ 60 selon la manip) dont...