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Bonjour,

Je souhaite volontairement créer des erreurs dans mon jeu de données, pour en étudier ensuite les effets.

Je dispose d'un data.frame comme suit :



Identifiant
Pere

Bonjour,

Merci pour votre réponse. J'ai tenté d'intégrer cela, mais j'ai un message d'erreur :





for (row in 1:nrow(df)){
for (col in 1:ncol(df)) {

Merci, j'ai réussi à résoudre le problème.
Bonne journée

J'ai un grand jeu de donnée provenant d'arbres qui se présente sous cette forme.




Clones
Individu
Allele1
Allele2
Allele3

Bonjour,

Je rencontre un soucis avec un script, ca fait plus d'une heure que je bloque dessus.
R me dit que j'ai des unmatched opening bracket.
Pourtant, après avoir relu mon code des dizaines...

J'ai un petit peu avancé sur ma fonction mais je rencontre un soucis.
Ma boucle ne tourne pas, et je ne comprend pas pourquoi


##########################################################
###...

Bonjour, merci pour votre réponse.

J'avais testé cette fonction qui marche bien. Le seul soucis c'est que cela s'applique a tout le data.frame.


Je souhaite remplacer les NAs colonne par...

Bonjour,

Après relecture, je constate (pour plusieurs raisons) qu'il serait préférable de d'abord compléter les valeurs manquantes, avant de comparer les génotypes.
J'ai commencé a écrire un...

Vous pouvez télécharger le jeu de données grâce à ce lien :
https://drive.google.com/file/d/1HDx1Dc7NABsAVDbmCDTEhDvxGIuD3Kd2/view

Merci infiniment pour votre aide.

Pour vous le script fonctionne avec mon jeu de données?
Etrange..



Les numéros de clones sont bien affichés dans la console.


Cela retourne des séries d’allèles dans la console.

Bonjour,

J'ai toujours un message d'erreur, different cette fois

Error in list_pattern_diff[.y, .x] : subscript out of bounds



df<-read.table(file='Bilan.csv', header = TRUE,sep=';')

Seulement des '_', les tirets du 8 pour la première ligne (nom des alleles)
Des tirets du 6 pour le nom des clones dans la première colonne

Et sinon, c'est juste des A, T, C, G ou NA pour les...

Bonjour,

Oui merci pour ces explications, c'est beaucoup plus clair pour moi désormais.
Par contre j'ai un message d'erreur, c'est du chinois :



...

Bonjour,

En réalité, c'est pas que je ne comprend pas les fonction utilisées, c'est plutot que je ne vois pas toujours vers où vous allez, et pourquoi vous faite ceci ou cela.

Par exemple, je...

Bonjour

Un grand merci pour votre aide.

Cependant, il a des parties de votre code où je ne comprends pas

Notamment à la ligne au début ou vous écrivez

df <-df %>% bind_cols(unite(data=df...

Bonjour,

J'ai un grand jeu de donnée provenant d'arbres.
Dans la première colonne, il y a ce que l'on appelle des numéro de clones. Chaque numéro de clone est présent en plusieurs copie (de 1 à...

Merci beaucoup pour votre aide.

Bonjour,

Je crois qu'en effet il fonctionne parfaitement, mais il y a juste un petit ajustements à faire (j'ai essayé en vain).
- dans la première colonne, chaque numéro d'individu doit être...

Bonjour,

Malheureusement cela ne résout pas l'erreur.
Error: Argument 2 must be length 0, not 1
7.
stop(structure(list(message = "Argument 2 must be length 0, not 1",
call = NULL,...

Bonjour,
Mon script est quasiment terminé, mais j'ai toujours une erreur que je ne comprend pas.




################## function to create a pedigree ################

# dam = female
# sire...

Bonjour,

Votre algo fait exactement ce que je demande.
J'ai juste modifié ceci :

psires <- sample(1:20)
pdams <-sample (21:50)
Car autrement les certains parents male/femelle portent me même...

Bonjour, en fait il n'y a pas de données, le script que j'utilise sert justement à les générer (données de pedigree, avec les parents de premiere génération, et les descendants "simulés").
Comme...

Bonjour,

J'obtiens l'erreur suivante :
Error in sample.int(length(x), size, replace, prob) :
invalid first argument
Traceback :
3.
sample.int(length(x), size, replace, prob)
2....

Bonjour,

Votre solution a fonctionné, le script tourne normalement. Par contre, le résultat que j'obtiens ne conviens pas. J'obtiens presque souvent des croisements identiques, et tout les parents...

Bonjour,

Merci beaucoup pour votre aide !
Je ne saisi pas a quoi sert et comment fonctionne "mutate(female = ifelse(is.na(female),female[1],female)) ## ligne qui traite du cas où les 2 vecteurs...