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Ok, donc en gros, si j'ai bien compris, le problème était résolu depuis ton post #5, où tu as dit :

Mais il fallait simplement que tu rediriges la sortie vers un fichier :

%awk% -F";" "$2 !=...

La commande que je t'ai donnée supprime les lignes dont les deuxième et troisième champs sont identiques.
Avec l'exemple que tu as donné en introduction, voici ce que j'obtiens :

$ awk -F';' '$2...

Les doublons c'est les lignes où les champs 2 et 3 sont identiques ?
Si c'est ça, il te suffit de faire

awk -F';' '$2 != $3' fichier