Discussion :

[PyBio]

Bonjour à tous,

Me revoila avec une question sur l'interfacage Python/C. Je me pose une question quasi existancielle

Description du problème

J'ouvre un fichier en python, je transmet le pointeur de fichier à une fonction C (via typemap adequat) qui lit quelques octets par exemple, et qui retourne le pointeur à python...

Question une fois dans python, je me retrouve au début du fichier ? ou alors à la dernière position du C ?

Merci pour vos 'futurs' avis.

PyBio.

[PyBio]

Bon un petit problèle de + dans la lignée de mon post précédent:

Je souhaite envoyer un objet file à une fonction C : fonction(FILE*...){...}

Pour cela j'utilise le typemap visiblement standard:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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%typemap(python,in) FILE *{
	if(!PyFile_Check($1)) {
		PyErr_SetString(PyExc_TypeError, "Need a file!");
		return NULL;
	}
	$result = PyFile_AsFile($1);
}

A la compilation j'obtiens ce type d'erreur :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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extractseq_wrap.c:1519: error: 'struct __sFILE' has no member named 'ob_type'
extractseq_wrap.c:1519: error: 'struct __sFILE' has no member named 'ob_type'

Voici le morceau du _wrap.c:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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    if(!PyArg_ParseTuple(args,(char *)"O:fileLength",&obj0)) goto fail;
    {
        if(!PyFile_Check(arg1)) { //---> ligne 1519.
            PyErr_SetString(PyExc_TypeError, "Need a file!");
            return NULL;
        }
        resultobj = PyFile_AsFile(arg1);
    }
    result = (int)fileLength(arg1);
 
    {
        resultobj = SWIG_From_int((int)(result)); 
    }

Je ne vois absolument pas comment régler ce problème.

Merci.
PyBio.