Discussion :

[Yuki_Hime]

Bonjour,

J'aurai besoin de votre aide pour rendre mes scripts beaucoup plus efficacent.

Problème n°1

J'ai une page d'acceuil ou l'utilisateur fait une requete, et un choix de sytème à étudier.Systématiquement, il y a création d'un fichier spécifique à la requete

script de la page d'acceuil:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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<?php
if(isset($_GET['requete'])) $requete = $_GET['requete'];
else $requete = $_POST['requete'];
 
if(isset($_POST['choix'])){//vérification de l'existance de "choix"
	if(!file_exists("/home/idris/My_php/Webdom/jobs/" .$requete))
           mkdir ("/home/idris/My_php/Webdom/jobs/" .$requete, 0775);    
	switch($_POST['choix']){
		case "proteine":
			header("location:../description_prot.php?requete=".$requete);
			break;
		case "domaine":			
                        header("location:../description_domain.php?requete=".$requete); 
			break;
		case "espece":	
                        header("location:../description_species.php?requete=".$requete);
			break;
	}
 
}?>

Lorsque je lance par exemple la première page, une commande est lancé dans un terminal
Les résultats sont stockés dans un fichier fetch.txt

script de la page 1

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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$requete_prodom= ('/home/idris/My_php/fetchdom/fetchdom-3.20/fetchdom -b /home/idris/My_php/fetchdom/fetchdom-3.20/prodom_v2005 -a '.$requete.' -fs " % " -t  id,kw,la,nd,dr,inn,inntype,ht,spnb,interpro,pdb,pfama,spac,prosite,go > fetch.txt') ;
exec($requete_prodom);
 
 
 
$resultat_requete= "";
$fichier = fopen("fetch.txt", "r");
if ($fichier) {
    while (!feof($fichier)) {
         $resultat_requete= $resultat_requete.fgets($fichier, 4096);
    }
    fclose($fichier);
}

Je voulais que ce fichier.txt se retrouve dans le fichier spécifique de la recherche , mais si je le déplace, le fopen ne fonctionne plus, j'ai voulu mettre le chemin dans le fopen, mais ça ne passe pas...........

auriez-vous une astuce à me conseiller ???

Problème n°2

Toujours dans le script de la page d'acceuil, je voulais rajouter des conditions dans le case de la page 2, mais ça plante à chaque fois et je ne comprend pas pourquoi

je voudrais que si l'utilisateur va sur cette page, que soit fait de façon systématique:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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<?php
...................  
	switch($_POST['choix']){
		case "proteine":
.........
		case "domaine":			
                        header("location:../description_domain.php?requete=".$requete); 
			break;
		case "espece":	
.............
	}
 
}?>

1) Que cette commande s'excécute et que le fichier aille sur le chemin écrit ci desous
fetchdom -b prodom_v2005 -s HBG000010 -t xdom > /home/idris/My_php/Webdom/jobs/'.$requete.'/conscensus.xdom;

2) Mettre les autorisations
chmod ("/home/idris/My_php/Webdom/jobs/$requete/consensus.xdom", 0775);
car après je n'arrive pas à supprimer le fichier sauf si je suis en SU

[samspitz]

salut

tu peux ouvrir avec fopen et ecrire avec un fwrite(location.....)
je pense cela suffira pour ton problème

++

[Yuki_Hime]

Fichu guillemets, c'était juste ça qui bloquais le chemin.........;

Problème 1

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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$requete_hogenom = ('/home/idris/My_php/fetchdom/fetchdom-3.20/fetchdom -b /home/idris/My_php/fetchdom/fetchdom-3.20/hogenom_v3 -a '.$requete.' -fs " % " -t  id,kw,la,nd,dr,inn,inntype,ht,spnb > /home/idris/My_php/Webdom/jobs/'.$requete.'/fetch.txt') ;
exec($requete_hogenom);
 
 
$resultat_requete= "";
$fichier = fopen("/home/idris/My_php/Webdom/jobs/".$requete."/fetch.txt", "r");
if ($fichier) {
    while (!feof($fichier)) {
         $resultat_requete= $resultat_requete.fgets($fichier, 4096);
    }
    fclose($fichier);
}

Problème 2

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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		case "domaine":			
                        header("location:../description_domain.php?requete=".$requete); 
			exec('fetchdom -b prodom_v2005 -s '.$requete.' -t xdom > /home/idris/My_php/Webdom/jobs/'.$requete.'/consensus.xdom');
			chmod ("/home/idris/My_php/Webdom/jobs/$requete/consensus.xdom", 0775);
			break;