Bonjour, j'essaye de mettre en évidence un résidu carbonylé dans une protéine pour cela, j'utilise jmol + fichier PDB, la détermination du résidu est réalisé à partir d'un fichier fasta, or il s'avère que dans les fichiers PDB il manque certains résidus.
Par exemple il est indiqué que pour la proteine xxx le résidus carbonylé est le numéro 90 et il s'agit de la proline. Or dans le fichier PDB le résidus 90 correspond a la valine.
Ma question est comment faire pour à tous les coups désigner le bon résidus dans le fichier PDB ?
J'ai bien pensé a calculer le Nombre de résidus dans le fichier fasta et PDB et de faire la différence et d'ajouter cette différence au numéro du résidu désigné mais ce n'est pas très rigoureux