Discussion :

[Kro86]

Bonjour,
Nouveau probleme, encore et toujours avec imageJ. Je viens de creer 2 plugins, l'un pour ameliorer la qualite de l'image et l'autre pour faire du suivi de molecules. Les 2 marchent separement mais si je les appliquent a la suite, le plugin d'amelioration marche tres bien mais le plugins de tracking ne marche plus, il ne me fait pas d'erreur a la compilation mais il se bloque en cours d'execution. Qqn aurait-il une idee du probleme que ca peut etre ?
Je ne vois pas vraiment d'ou cela peut venir. Ce sont bien les memes types d'images 8-bit.
Merci d'avance pour vos idees.

Est-il possible qu'en utilisant des fonctions de traitement d'image comme un filtre ou un seuillage, j'ai modifie le format ou les caracteristiques de l'image ? C'est tres etrange car lorsque j'utilise matlab pour ameliorer la qualite de l'image mon plugin de tracking marche parfaitement et lorsque j'utilise mon autre plugin sur imageJ ( en obtenant a peu pres une image de meme qualite) mon plugin de tracking ne marche plus.
J'ai vraiment besoin de suggestions car je ne vois vraiment pas ce qu'il se passe.

[ToTo13]

Bonjour,

il faut voir ce que tu appelles ne marche plus. Est ce que tu es sûr de toujours travailler sur la même image ?
Est ce qu'en utilisant le plugin, il ne t'a pas fournit une autre image résultat placé différemment dans le WindowManager ?

[Kro86]

Je travaille bien sur la meme image mais fournie par 2 programmes differents. En fait, qd je dis qu'il ne marche plus, c'est qu'il se lance bien mais des qu'il y a un deplacement de la molecule, il beugue et il fait planter imageJ. Mon suivi de molecules marche parfaitement sur les images obtenues avec Matlab. Je ne vois donc pas ce qui fait planter mon programme.

[ToTo13]

euh... la comme ça... sans plus d'information... la meilleure solution est... www.BouleDeCristal.fr

A quel ligne est ce que ça plante ?
Quel type de plantage est ce ? (exception, erreur, ...)

[Kro86]

Bonjour
Desolee, c'est sur que je ne suis pas tres claire. En fait il plante parce qu'il est dans une boucle infinie ou du moins il agit comme tel.
J'ai trouve la fonction au niveau de laquelle il se bloque mais je ne comprends pas pourquoi.

Code :

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// function to calculate the coordinates y of the molecule's centroid
	public int centroidY (ImageProcessor ip, int x, int y) {	
 
		int val = 0;
		int i = y;
		while (val  == 0) {
			i --;
			val = ip.getPixel(x,i);
		}
		int j = y;
		val = 0;
		while (val  == 0) {
			j ++;
			val = ip.getPixel(x,j);
		}
		return ((i+j)/2);
	}

J'ai utilise exactement la meme fonction pour les coordonnes en x et ca marche tres bien. Donc je ne comprends pas. Si je n'appelle pas cette fonction mon programme fonctionne mais ne me renvoie plus les bonnes coordonnees forcement. Ce que je ne comprends pas c'est comment mon plugin d'amelioration d'image peut modifier l'execution de mon plugin de tracking.
Merci pour votre aide.

Est-il possible que lorsque j'utilise mon plugin d'amelioration et de binerisation d'une video, celle ci ne soit pas reellement changee ? Je veux dire comment etre sur que les modifications apportees ne sont pas valables qu'au sein du plugin. J'ai un doute et je cherche toutes les explications possibles car c'est vraiment etrange ce qu'il se passe.

[Kro86]

Pas de panique c'est moi qui suis trop bete. En fait la fonction threshold d'inageJ renvoie les pixels noirs avec une valeur de 255 et les pixels blancs avec une valeur de 0. Or mon plugins de tracking utilise l'inverse et ceci explique donc mes resultats tres bizarres.
Merci d'avoir perdu du temps avec mes betises dsl.