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MATLAB Discussion :

[fread] Out of memory


Sujet :

MATLAB

Vue hybride

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  1. #1
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    Par défaut [fread] Out of memory
    Bonjour,
    J'ai un fichier binaire contenant une grille avec des valeurs. Le problème est qu'il y a que la grille est assez conséquente [21601,10801]. Quand j'essaie de lire le fichier avec fread (voir code), j'ai un message d'erreur qui me dit OUT OF MEMORY.
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    1
    2
    3
    4
     
    fid=fopen('D:\Mes documents\bathymetrie\gebco_bathy.21601x10801.bin','r'); 
    IM = fread(fid,[21601,10801]) ;
    fclose(fid);
    Ce que je pourrais faire, c'est lire seulement une partie du fichier en découpant l'image, mais je ne sais pas comment découper l'image avant de l'avoir lue. Après la lecture je pourrais découper l'image comme ça:
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    1
    2
    3
    IM=IM';
    IMTL=IM(1300:2200,200:1100);
    image(IMTL)
    Malheureusement je ne sais pas comment intégrer le découpage avant la lecture.

  2. #2
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    Par défaut
    L'erreur est inévitable ici. Tout d'abord, il est nécessaire de comprendre comment Matlab gère la mémoire
    Dans ton cas particulier, lorsque tu utilises :
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    IM=fread(fid,[21601,10801]);
    Matlab retourne IM comme une matrice de type double (8 octets) soit :

    21601*10801*8/1024/1024/1024 = 1.7 Go

    Dans un premier temps, si tu connais le type des données, par exemple uint8 (1 octet), tu peux faire ceci :
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    1
    2
    3
    IM=fread(fid,[21601,10801],'uint8=>uint8');
    %ou
    IM=fread(fid,[21601,10801],'*uint8');
    ce qui retournera IM de type uint8 soit une taille de :

    21601*10801/1024/1024 = 222 Mo

  3. #3
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    Par défaut
    merci beaucoup, ça marche mieux comme ça.

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