Discussion :

[GLDavid]

Bonjour

Sur un cluster disposant de mpi (pour de la parallélisation), je veux lancer l'environnement via une classe Java.
Voici la méthode que j'ai écrit :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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private int lamboot(){
		String cmd = "lamboot -ssi boot_rsh_agent 'ssh -x' -ssi rsh_agent 'ssh -x' lamhosts";
		System.out.println(cmd);
		try{
			java.lang.Process process = Runtime.getRuntime().exec(cmd);
			process.waitFor();
			this.error = new java.io.BufferedReader(new java.io.InputStreamReader(process.getErrorStream()));
			this.stdout = new java.io.BufferedReader(new java.io.InputStreamReader(process.getInputStream()));
 
			Thread tout = new Thread(){
				public void run(){
					String out = "";
					try{
						while((out = mpiBLAST.this.stdout.readLine())!=null){
							System.out.println(out);
						}
					}
					catch(java.io.IOException ioe){
						return;
					}
				}
			};
			tout.start();
 
			Thread terr = new Thread(){
				public void run(){
					String err = "";
					try{
						while((err = mpiBLAST.this.error.readLine())!=null){
							System.err.println(err);
						}
					}
					catch(java.io.IOException ioe){
						return;
					}
				}
			};
			terr.start();
		}
		catch(IOException ioe){
			return 1;
		}
		catch(InterruptedException ie){
			return 1;
		}
		return 0;
	}

Ok, la méthode n'est pas supère mais là n'est pas le problème.
Mon souci est que lorsque j'invoque le exec, le process lamboot me lance l'aide, synonyme d'une erreur. Pourtant, si je tape la même ligne en shell, tout se passe bien. Y a t'il un détail qui m'a échappé ?

Merci d'avance.

@++

[le y@m's]

Je penche pour un problème au niveau des espaces dans les arguments de ta ligne de commande.
Quand tu as des espaces dans les arguments de ta ligne de commande, il est préférable d'utiliser la méthode exec(String[]).

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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String[] cmd = { "lamboot", 
                 "-ssi", 
                 "boot_rsh_agent",  
                 "ssh -x", 
                 "-ssi",  
                 "rsh_agent",  
                 "ssh -x", "lamhosts" };
java.lang.Process process = Runtime.getRuntime().exec(cmd);

[GLDavid]

Oki

A essayer ce soir sinon lundi si je n'ai plus de force
Merci de ta réponse.

@++

[GLDavid]

A marche !
Merci le y@m's

@++