Discussion :

[m01x75]

Bonjour à tous,
je converti un fichier excel sous forme de dataframe pour faire d'autres manipulations ensuite, sauf qu'à la fin je me suis rendue compte que j'avais des valeurs suivi d'un espace (à droite) que je n'avais pas vu.

Voici mon code

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
6
7
8
# Convert xlsx file in dataframe and filter on column
data = pd.read_excel(sys.argv[1])
data_filter = pd.DataFrame(data, columns = ["Strain ID", "Test result"])
 
# Remove right space and duplicates and not defined row in dataframe
data_filter = data_filter[data_filter["Test result"].str.rstrip()]
data_filter.drop_duplicates(keep = 'first', inplace=True)
print(data_filter)

Les espaces qui m'embêtent sont dans la colonne "Test result" du dataframe et la méhode str.rstrip renvoi l'erreur suivante que j'avoue ne pas bien comprendre :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
File "/Softs/virtualenvPython/Genome_panel/lib/python3.8/site-packages/pandas/core/indexes/base.py", line 5782, in _get_indexer_strict
    self._raise_if_missing(keyarr, indexer, axis_name)
  File "/Softs/virtualenvPython/Genome_panel/lib/python3.8/site-packages/pandas/core/indexes/base.py", line 5842, in _raise_if_missing
    raise KeyError(f"None of [{key}] are in the [{axis_name}]")

Merci d'avance pour votre aide

[wiztricks]

Salut,

Il semble plutôt que c'est data_filter["Test result"] qui ne trouve pas la colonne plutôt que str.rstrip. Reste à voir à quoi ressemble le DataFrame et chercher un peu sur Internet pour voir ce qu'on fait ceux qui ont eu des problèmes similaires.

- W