Discussion :

[skinouch7102]

Bonjour à tous,

Je suis novice avec ImageJ, j'ai cherché une réponse sur le net sans succès.
Après avoir sélectionner une zone, je souhaite créer une macro qui me permettrait de calculer le pourcentage de pixels blanc situés dans la zone préalablement sélectionné.

Merci

[Tchoukatroc]

Bonjour,

Tu as la fonction dans"Image", "Adjust", "Threshold" qui te permet de sélectionner les pixels en fonctions de leur intensité. Il faut que tu définisses à quel seuil tes pixels sont considérés comme blanc. De quelles sortes sont tes images? Binaires(0 = pixel noir, 1 = pixels blanc)? En niveau de gris? Une fois que tu as défini un threshold, tu fais une mesure limitée au threshold, pour cela, tu vas dans "Analyse", "SetMeasurments" et tu coche "limit to thresold". Ensuite, tu fais le ratio entre l'aire mesurée sans threshold et l'aire obtenue avec ton threshold et tu obtiendras le pourcentage.

[skinouch7102]

Mes images sont binaires, noir ou blanc, du coup je n'ai pas besoin de passer par le threshold. dans ce cas, y a t-il un moyen de mesurer l'aire des pixels blancs dans ma zone?
dans tous les cas, merci beaucoup pour la réponse, je vais utiliser votre méthode en attendant de voir si une méthode existe avec les pixels binarisé.

[Tchoukatroc]

Si ton image est binaire, tu as juste à faire une mesure de ton image entière ou une région d'intérêt qui va te donner la somme des pixels. Vu que les pixels blancs valent 1 et les noirs valent 0, la somme des pixels correspondra au nombre de pixels blanc. Pour faire la mesure va d'abbord dans "Analyse", "SetMeasurment" et coche "integrated density" (qui correspond à la somme des pixels). Ensuite va sur ton image et fait ta mesure dans "Analyse", "Measure" (ou presse tout simplement la touche m sur ton clavier m). La valeur "RawIntegratedDensity" correspondra à la somme de tout tes pixels, donc au nombre de pixel blancs.