Discussion :

[nat8546]

Bonjour,
Je souhaiterai savoir comment explorer (et exploiter) des fichiers.h5 avec python.
J'ai installé le package h5py et j'ai tenté

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

 data=h5py.Fichier(monfichier.h5,'r')

Mais ça ne me sors rien.
Quelqu'un aurait il une explication et une solution à mes malheurs ?

Merci beaucoup

[VinsS]

Salut,

Des exemples sont fournis: https://github.com/h5py/h5py/tree/master/examples

Il semble que ce soit plutôt h5py.File(monfichier.h5,'r')

[nat8546]

Euh oui, c'est bien File que j'ai utilisé ^^

[nat8546]

En gros le code utilisé fonctionne (pas de message d'erreur) mais je n'ai rien dans mon environnement local (explorateur de variable).
Du coup j'ai pas très bien compris comment aller chercher les sous dossiers de mon fichier.h5.

[wiztricks]

Salut,

Mais ça ne me sors rien.
Quelqu'un aurait il une explication et une solution à mes malheurs ?

Qu'attendiez vous que çà fasse?
Un fichier, un site internet, ... sont des objets externes. Pour les utiliser, la première étape se passe toujours par la création d'une entité qui fera le lien entre le programme et cette entité externe. Après il faut (apprendre à) utiliser les méthodes/fonctions associées pour accéder aux données/informations/structures.

- W

[nat8546]

Je dois vous avouer que je ne sais pas trop.
Normalement ça me sort des bases de données.

Je vais essayer de regarder ça de plus près. Merci

[nat8546]

Ok donc j'ai mon fichier.h5
C'est un fichier contenant des sous dossiers avec des bases de données.

Globalement sous python version 2 on peut faire le code suivant :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
My_file = h5py.File(fichier.h5,'r') 
My_file.keys()

La dernière ligne de code donne les noms des sous dossiers.
Sauf que sous python version 3, cette commande donne un objet, et donc n'est pas visualisable.

Existe-t-il des commandes analogues pour python version 3 ?
Merci

[wiztricks]

Salut,

Existe-t-il des commandes analogues pour python version 3 ?

My_file étant une sorte de dictionnaire, sous Python3, .keys() est un itérable. Pour voir quelque chose, il faut en faire quelque chose par exemple list(My_file.keys())- W

[nat8546]

C'est bon ça a marché.
En faisant le code suivant :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
my_file=h5py.File(file.h5,'r')
list(my_file.keys())
data=np.asarray(my_file[list(my_file.keys())[0]])

ça me sort bien la base de données liée à l'index 0 de ma liste.

Bref ça marche, merci !