Discussion :

[Guidon26]

Bonjour, je suis un étudiant en biologie et je ne connais pas grand chose en informatique. Dans le cadre de mon stage j'utilise image j. J'ai réaliser une macro mais elle ne se lance pas le logiciel m'affiche " no dialog created with Dialog.create() in line 2. Dialog.<addChoice>("Files extension", newArray("all",.png","tif,".jpg"));
voici ma macro:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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Dialog.addChoice("Files extension", newArray("all", ".png", ".tif", ".jpg"));
 
inputDir = getDirectory("Choose the input directory ");
outputDir = getDirectory("Choose the output directory ");
imageType = Dialog.getChoice;
 
inputFilesList = getFileList(inputDir);
for (i=0; i < inputFilesList.length; i++){
	if( imageType == "all"){
		if( !endsWith(inputFilesList[i], "/") ){
			maxProject(inputDir, outputDir, inputFilesList[i]);
		}
	}
	else{
		if( endsWith(inputFilesList[i], imageType)){
			maxProject(inputDir, outputDir, inputFilesList[i]);
		}
	}
}
 
function maxProject(inputDir, outputDir, imageName){
	open(inputDir + imageName);
	run("Split Channels");
       selectWindow("Image j.png (blue)");
       close();
       selectWindow("Image j.png (red)");
       close();
       selectWindow("Image j.png (green)");
       setAutoThreshold("Default dark");
       //run("Threshold...");
       //setThreshold(180, 255);
       setOption("BlackBackground", false);
       run("Convert to Mask");
 
	saveAs("Tiff", outputDir + "MAX_" + imageName);
} 
 
 
 
close();

Merci pour votre aide

[Tchoukatroc]

Salut,

Pour créer une boite de dialogue, tu dois d’abord appeler la fonction Dialog.create("Title").
Ensuite, tu mets tes éléments dedans, donc dans ton cas Dialog.addChoice("Files extension", newArray("all", ".png", ".tif", ".jpg")).
Puis, tu affiche la boite de dialogue avec Dialog.show(). Les functions telles que imageType = Dialog.getChoice; doivent être placées après Dialog.show();

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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Dialog.create("Title");
Dialog.addChoice("Files extension", newArray("all", ".png", ".tif", ".jpg"));
Dialog.show();
 
imageType = Dialog.getChoice;

Bonne journée,

Cédric

[Guidon26]

Bonjour,
Je te remercie pour ta réponse. Avec ton aide je peut désormais choisir le type de fichier et aussi je d'entrée et de sorti choisir mes dossier d'entrée et de sorti cependant lorsque je lance la macro un autre message d'erreur apparaît: dialog error line 11: imageType=Dialog <getchoice>.
Ma macro consiste à convertir les image en 3 canaux RGB, je garde le canal vert puis je le binarise au seuil 180.
Je te remercie encore une fois pour ton aide.

[Guidon26]

Je vient de m'apercevoir de mon erreur: "imageType = Dialog.getChoice;"était écrit deux fois. La macro fonctionne cependant je n'obtient pas les mêmes résultats que lorsque je réalise les étapes moi même. As tu une idée de ou pourrait venir l'erreur? Merci

[Guidon26]

J'ai apporté quelque modification et maintenant le programme fonctionne correctement, je te remercie sincèrement de ton aide

[Tchoukatroc]

Super que ta macro fonctionne. Aussi, j'ajouterais des parenthèse après la fonction getChoice, elle est documentée ainsi. Je ne sais pas si ça a de l'importance, j'ai toujours mis ces parenthèses, mais ça pourrait éviter des bugs dans la macro.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

Dialog.getChoice();