Discussion :

[karuzel]

Bonjour,

J'ai constaté un problème assez gênant:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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def trouve_prot():
    iput=raw_input("Enter the protein's code (ex: 4S18) : ")
    print "\n"
    url=urllib.urlopen("http://www.rcsb.org/pdb/download/downloadFile.do?fileFormat=pdb&compression=NO&structureId="+str(iput))
    pdbfile=url.readlines()
print pdbfile

Quand je l'exécute:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

name 'pdbfile' is not defined

Je ne comprend pas, je le définis pourtant bien avec cette ligne pourtant:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

pdbfile=url.readlines()

Quelqu'un peut-il m'expliquer comment faire pour contourner ce problème ?

Merci d'avance

[cervo]

ta variable pdbfile est locale par rapport à ta fonction, si tu veux l'utiliser en dehors declare pdbfile globale avant.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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def trouve_prot():
    global pdbfile
    iput=raw_input("Enter the protein's code (ex: 4S18) : ")
    print "\n"
    url=urllib.urlopen("http://www.rcsb.org/pdb/download/downloadFile.do?fileFormat=pdb&compression=NO&structureId="+str(iput))
    pdbfile=url.readlines()
 
print pdbfile

[karuzel]

Salut cervo,

Impec', ça fonctionne !! Merci beaucoup

[Dan737]

D'accord avec la méthode de Clodion. Faire de pdbfile une variable globale semble inutile.

[karuzel]

Ah oui, pas mal ta méthode clodion.

Dans mon cas, les 2 fonctionnent

[Clodion]

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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def trouve_prot():
    iput=raw_input("Enter the protein's code (ex: 4S18) : ")
    print "\n"
    url=urllib.urlopen("http://www.rcsb.org/pdb/download/downloadFile.do?fileFormat=pdb&compression=NO&structureId="+str(iput))
    pdbfile=url.readlines()
print pdbfile

Quand je l'exécute:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

name 'pdbfile' is not defined

Bonsoir,
@cervo +1
D'où l'intérêt de comprendre les fonctions. Et de les exécuter pour obtenir un résultat.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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def trouve_prot():
    iput=raw_input("Enter the protein's code (ex: 4S18) : ")
    url=urllib.urlopen("http://www.rcsb.org/pdb/download/downloadFile.do?fileFormat=pdb&compression=NO&structureId="+str(iput))
    return url.readlines()
 
pdbfile = trouve_prot()
print pdbfile

Clodion